231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1676 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0039  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0122  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0598  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0685  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0707  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000230067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1166  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0209729  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1293  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1364  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1494  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1592  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.673997  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1634  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1676  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1796  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1965  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2300  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00950484  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2329  transposase  100 
 
 
86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B2  transposase  98.84 
 
 
86 aa  171  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D09  transposase  98.84 
 
 
86 aa  171  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.874823  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0114  transposase  98.84 
 
 
86 aa  171  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000229736  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1358  transposase  98.84 
 
 
86 aa  171  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.695089  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0962  transposase  98.84 
 
 
86 aa  170  6.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000493286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0992  transposase  98.84 
 
 
86 aa  170  6.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0284709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1213  transposase  98.84 
 
 
86 aa  170  6.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.474133  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0352  transposase  98.84 
 
 
86 aa  169  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.155473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1872  transposase  98.84 
 
 
86 aa  169  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0579808  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1994  transposase  98.84 
 
 
86 aa  169  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.330535  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1505  transposase  98.84 
 
 
86 aa  168  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105663  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1929  transposase  97.67 
 
 
86 aa  167  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0680  transposase  97.67 
 
 
86 aa  167  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0306806  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C58  transposase  94.74 
 
 
77 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0811  transposase  93.65 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.415253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1507  transposase IS3/IS911 family protein  47.67 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000019748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0764  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.416197  hitchhiker  0.0022946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2828  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1530  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000372695 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0799  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0297207  hitchhiker  0.00184796 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2525  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0762  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0302585  hitchhiker  0.00264587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0758  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0453356  hitchhiker  0.00246482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0714  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1978  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1528  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000359227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1985  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.982856  normal  0.0748906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2131  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1592  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000200325  unclonable  8.37308e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2554  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0256  transposase IS3/IS911 family protein  42.35 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.103856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2164  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0780617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2284  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1945  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1241  IS3 family transposase OrfA  36.78 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00141321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0760  transposase IS3/IS911 family protein  31.4 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C03  transposase  34.48 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0640  IS3 family transposase OrfA  35.63 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0513  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0520  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0692  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0703  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0705  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640012  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0709  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2397  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2401  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0789235  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3188  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  32.58 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  32.94 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  32.94 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  32.94 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  32.94 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  32.94 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  32.94 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  32.94 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2223  transposase  28.09 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  36.47 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  34.12 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>