More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2223 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2223  transposase  100 
 
 
92 aa  188  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1228  ISSdy1, transposase OrfA  43.96 
 
 
96 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000245829  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1243  ISSdy1, transposase OrfA  42.86 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000354478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0398  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0287  transposase  40 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0441  transposase IS3/IS911 family protein  36.78 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1592  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000200325  unclonable  8.37308e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0799  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0297207  hitchhiker  0.00184796 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1530  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000372695 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0758  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0453356  hitchhiker  0.00246482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2554  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1985  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.982856  normal  0.0748906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2525  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1978  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2131  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2828  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0762  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0302585  hitchhiker  0.00264587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0764  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.416197  hitchhiker  0.0022946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1528  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000359227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0714  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1507  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000019748 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1495  transposase  35.23 
 
 
87 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0800  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0256  transposase IS3/IS911 family protein  31.52 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.103856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1945  transposase IS3/IS911 family protein  31.52 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2164  transposase IS3/IS911 family protein  31.52 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0780617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2284  transposase IS3/IS911 family protein  31.52 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0082  transposase  31.87 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76598 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0012  transposase  31.87 
 
 
105 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.671169  normal  0.107805 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1241  IS3 family transposase OrfA  36.05 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00141321  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  34.78 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0640  IS3 family transposase OrfA  36.05 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C03  transposase  34.88 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0039  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0122  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0598  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0685  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0707  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000230067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0962  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000493286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0992  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0284709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1166  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0209729  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1293  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1364  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1494  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1592  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.673997  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1634  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1676  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1796  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1965  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2300  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00950484  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2329  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B2  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D09  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.874823  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0114  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000229736  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1358  transposase  28.09 
 
 
86 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.695089  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7354  transposase IS3/IS911 family protein  28.09 
 
 
105 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124441 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1994  transposase  28.09 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.330535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  31.87 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0680  transposase  28.89 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0306806  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1213  transposase  26.97 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.474133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2547  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0352  transposase  26.97 
 
 
86 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.155473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1872  transposase  26.97 
 
 
86 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0579808  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  32.97 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  32.97 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  32.97 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0015  IS911, transposase orfA  32.98 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C58  transposase  30.49 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1505  transposase  26.97 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105663  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1929  transposase  26.97 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0513  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0520  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0692  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0703  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0705  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640012  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0709  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2397  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2401  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0789235  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3188  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  32.97 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3351  transposase IS3/IS911 family protein  30.53 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0772  transposase IS3/IS911 family protein  31.18 
 
 
105 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4216  transposase IS3/IS911 family protein  31.18 
 
 
105 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  28.89 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5937  transposase IS3/IS911  28.43 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  28.89 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2226  transposase IS3/IS911  32.53 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  31.87 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  31.87 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  31.87 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  31.87 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  31.87 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>