169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0837 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0837  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  162  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0492349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  47.62 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0737  hypothetical protein  45.24 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0685  hypothetical protein  45.24 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0869  hypothetical protein  45.24 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000891846 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0671  hypothetical protein  45.24 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0936  hypothetical protein  45.24 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000387132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0775  hypothetical protein  45.24 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0829  hypothetical protein  45.24 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00649804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  45.24 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0865  hypothetical protein  45.24 
 
 
87 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0072  hypothetical protein  44.58 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0074  hypothetical protein  44.58 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2639  protein of unknown function DUF156  40.48 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.975232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  43.9 
 
 
86 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2433  hypothetical protein  41.46 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2514  hypothetical protein  41.46 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.193584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0036  hypothetical protein  41.46 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0036  hypothetical protein  41.46 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  42.86 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A01  hypothetical protein  42.11 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0821974  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0351  nickel resistance determinant  41.77 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000183122  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0154  protein of unknown function DUF156  45.9 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.98123  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  47.06 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  45.59 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  43.66 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  44.78 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  44.78 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0834  protein of unknown function DUF156  44.12 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  44.78 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1970  protein of unknown function DUF156  45.16 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376107  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  41.67 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  41.18 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  52.83 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1705  protein of unknown function DUF156  50.98 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0837339  normal  0.822352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  41.67 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0121  hypothetical protein  36.49 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  50.94 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  50.94 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  50.94 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  43.75 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  43.28 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  43.48 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3746  hypothetical protein  56.41 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3082  hypothetical protein  47.06 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21650  hypothetical protein  43.06 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1211  hypothetical protein  46 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5753  hypothetical protein  41.18 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286958  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0240  protein of unknown function DUF156  36.49 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  45.61 
 
 
85 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  34.72 
 
 
90 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1899  hypothetical protein  45.1 
 
 
87 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781804  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3563  hypothetical protein  28.21 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2725  protein of unknown function DUF156  37.84 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3757  hypothetical protein  51.28 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  38.03 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0465  hypothetical protein  34.33 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0277  protein of unknown function DUF156  35.14 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00351414  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2002  hypothetical protein  33.78 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  38.89 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  37.74 
 
 
93 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3638  hypothetical protein  32.84 
 
 
96 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2039  protein of unknown function DUF156  47.06 
 
 
89 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00245608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2171  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
96 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2051  protein of unknown function DUF156  44.19 
 
 
96 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.44014e-26 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  36.62 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  36.54 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  34.29 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3360  hypothetical protein  38.03 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552779  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2226  hypothetical protein  41.18 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  34.21 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  40.35 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0184  hypothetical protein  32.53 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2087  hypothetical protein  35.82 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.0236957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1959  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  40.35 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06025  hypothetical protein  32.84 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1741  protein of unknown function DUF156  26.83 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1531  hypothetical protein  40.91 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  35.71 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  38.46 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  31.33 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4106  hypothetical protein  33.87 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0298431  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  34.25 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  35.19 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  47.37 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11230  hypothetical protein  31.08 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.499044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  44.3  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0130  protein of unknown function DUF156  33.9 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1747  putative cytoplasmic protein  29.17 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.330539  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1529  putative cytoplasmic protein  29.17 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.434417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  32.73 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1742  putative cytoplasmic protein  29.17 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224779  normal  0.281419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1806  hypothetical protein  29.17 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1714  hypothetical protein  29.17 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.0184205 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  36.54 
 
 
91 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  31.88 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>