More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3638 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3638  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1531  hypothetical protein  86.46 
 
 
96 aa  173  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2171  protein of unknown function DUF156  79.17 
 
 
96 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2051  protein of unknown function DUF156  78.12 
 
 
96 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.44014e-26 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1741  protein of unknown function DUF156  47.73 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  40.86 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  45.57 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  45.57 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  39.13 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  37.63 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  41.18 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  38.71 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  57.69 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  57.69 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1271  protein of unknown function DUF156  46.77 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.858801  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  39.56 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  39.56 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  39.56 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  39.56 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  37.63 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  39.56 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  39.56 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  37.78 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  39.56 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  39.56 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  39.56 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  40.45 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  42.35 
 
 
110 aa  67  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  44.78 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  44.78 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  40.45 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  52.73 
 
 
103 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2597  protein of unknown function DUF156  41.76 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4242  protein of unknown function DUF156  41.76 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  49.38 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  40.66 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  42.35 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  36.96 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  55.77 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  41.67 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  38.46 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  51.72 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  48.33 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  48.33 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  44.93 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  48.33 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3671  protein of unknown function DUF156  38.54 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  38.82 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  48.33 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  49.18 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0673  hypothetical protein  47.46 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121389  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1694  hypothetical protein  34.83 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.607073  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  40.96 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  37.63 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0017  hypothetical protein  39.47 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  46.15 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  48.28 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3668  hypothetical protein  36.17 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  42.86 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  41.03 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  38.82 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  49.23 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  50 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  40.91 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  54.9 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  50 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  52.83 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  37 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  47.46 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  53.85 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  46.88 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3243  hypothetical protein  49.12 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  44 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  52.94 
 
 
121 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2676  hypothetical protein  44.62 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  37.65 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  37.65 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  52.94 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  49.15 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  49.15 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2851  hypothetical protein  49.15 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  43.48 
 
 
81 aa  60.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0438  protein of unknown function DUF156  36.78 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0914  hypothetical protein  49.15 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  45.45 
 
 
91 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  51.92 
 
 
93 aa  60.5  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3728  protein of unknown function DUF156  34.44 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00718584  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  46.03 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  55.77 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0988  protein of unknown function DUF156  37.18 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.11096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  49.21 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  55.77 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  34.12 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  46.15 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>