263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2433 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2433  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  166  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2514  hypothetical protein  81.4 
 
 
86 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.193584  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0036  hypothetical protein  81.4 
 
 
86 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0036  hypothetical protein  81.4 
 
 
86 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0074  hypothetical protein  76.74 
 
 
86 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0072  hypothetical protein  76.74 
 
 
86 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  51.16 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
86 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  49.43 
 
 
87 aa  94  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0865  hypothetical protein  48.28 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0737  hypothetical protein  48.28 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0685  hypothetical protein  48.28 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0671  hypothetical protein  48.28 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0775  hypothetical protein  48.28 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0829  hypothetical protein  48.28 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00649804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0869  hypothetical protein  48.28 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000891846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0936  hypothetical protein  48.28 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000387132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  48.28 
 
 
87 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2639  protein of unknown function DUF156  41.86 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.975232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0837  hypothetical protein  41.46 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0492349  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0351  nickel resistance determinant  42.53 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000183122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  38.46 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1970  protein of unknown function DUF156  36.23 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376107  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21310  hypothetical protein  35.21 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.643143  hitchhiker  0.00553883 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A01  hypothetical protein  38.46 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0821974  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  39.44 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  34.29 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  43.64 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  36.14 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  42.42 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  35.06 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  33.85 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  36.76 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  37.7 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  36.76 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  37.5 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  41.82 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21650  hypothetical protein  34.15 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  32.05 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01250  hypothetical protein  31.76 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  35.48 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  39.13 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  36.23 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  38.57 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  38.57 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  36.23 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  34.29 
 
 
90 aa  53.9  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0834  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1421  hypothetical protein  32.1 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0973225  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  32.05 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  32.89 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06025  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  30.65 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  29.27 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  35.29 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  25.93 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  30.26 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3691  hypothetical protein  31.58 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.32018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  28.4 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1210  protein of unknown function DUF156  33.72 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  30.23 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5753  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286958  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  29.63 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  36.36 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2884  hypothetical protein  29.27 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.4932  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0121  hypothetical protein  38.1 
 
 
86 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  32.94 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  27.69 
 
 
122 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  27.71 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0248  hypothetical protein  38.57 
 
 
97 aa  52  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  32.05 
 
 
98 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  37.14 
 
 
103 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0892  hypothetical protein  26.58 
 
 
92 aa  51.2  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.86741e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  42.31 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  29.82 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11230  hypothetical protein  38.36 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.499044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0240  protein of unknown function DUF156  36.07 
 
 
76 aa  50.8  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3942  hypothetical protein  38.89 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  28.21 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  35 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  38.18 
 
 
91 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0154  protein of unknown function DUF156  32 
 
 
103 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.98123  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3671  protein of unknown function DUF156  29.27 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  34.15 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2002  hypothetical protein  29.17 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  27.85 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  32.14 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1747  protein of unknown function DUF156  29.58 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00210309  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  40.38 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  28.75 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  28.75 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  30.67 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0617  hypothetical protein  30.86 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3638  hypothetical protein  36.23 
 
 
96 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>