210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00950 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00950  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  100 
 
 
207 aa  415  1e-115  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1375  DSBA oxidoreductase  42.11 
 
 
215 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.03023e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8164  hypothetical protein  41.31 
 
 
213 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.170702 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1922  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  34.93 
 
 
216 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1759  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  35.9 
 
 
216 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2002  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  34.45 
 
 
216 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1737  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  34.45 
 
 
216 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1792  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 
216 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.99943e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2023  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  33.97 
 
 
216 aa  141  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3421  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  33.97 
 
 
216 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.59947e-07 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1780  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  33.97 
 
 
216 aa  140  1e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00151932  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1918  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  33.97 
 
 
216 aa  140  1e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.017598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1954  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  33.97 
 
 
216 aa  140  1e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22125e-14 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  32.51 
 
 
210 aa  113  2e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  31.08 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  28.78 
 
 
233 aa  85.1  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 
216 aa  81.6  6e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 
213 aa  80.9  1e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 
221 aa  78.6  5e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 
240 aa  76.3  3e-13  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  24.76 
 
 
217 aa  76.3  3e-13  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0131  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 
219 aa  76.3  3e-13  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0361  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 
219 aa  75.1  6e-13  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.843248 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  30.05 
 
 
224 aa  75.1  7e-13  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  30.05 
 
 
224 aa  75.1  7e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  25.94 
 
 
223 aa  75.1  7e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  29.36 
 
 
223 aa  74.7  8e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 
207 aa  74.7  9e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  26.39 
 
 
221 aa  74.3  1e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  25.6 
 
 
216 aa  74.3  1e-12  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 
231 aa  73.6  2e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  2.21384e-05 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 
221 aa  73.9  2e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  25.64 
 
 
220 aa  73.9  2e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 
213 aa  73.2  3e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
222 aa  72.8  3e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 
223 aa  73.2  3e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  26.76 
 
 
211 aa  72  6e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 
236 aa  72  6e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1160  dithiol-disulfide isomerase  24.53 
 
 
223 aa  71.6  7e-12  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.67454e-06  hitchhiker  3.85744e-21 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 
220 aa  70.9  1e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  25.67 
 
 
234 aa  70.9  1e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 
256 aa  70.5  1e-11  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  28.75 
 
 
210 aa  70.5  2e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  25.12 
 
 
243 aa  70.1  2e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  26.29 
 
 
243 aa  69.7  3e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 
235 aa  69.7  3e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 
224 aa  69.7  3e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  26.32 
 
 
214 aa  69.3  4e-11  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3451  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 
201 aa  69.3  4e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 
235 aa  68.9  5e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  27.49 
 
 
214 aa  68.2  8e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 
244 aa  68.2  9e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 
215 aa  68.2  9e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  27.37 
 
 
242 aa  67.8  1e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  25.37 
 
 
201 aa  67.8  1e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  26.29 
 
 
243 aa  67.8  1e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  26.29 
 
 
243 aa  67.8  1e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  27.13 
 
 
217 aa  67.4  1e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 
214 aa  66.6  2e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 
211 aa  66.6  2e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  25.82 
 
 
243 aa  66.6  2e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 
214 aa  67.4  2e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  25.82 
 
 
243 aa  67  2e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 
220 aa  67  2e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  27.83 
 
 
214 aa  66.2  3e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 
219 aa  66.2  3e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  29.41 
 
 
227 aa  65.9  4e-10  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 
244 aa  65.9  4e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  27.43 
 
 
208 aa  65.9  4e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  27.41 
 
 
231 aa  65.9  4e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  25.35 
 
 
243 aa  66.2  4e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 
216 aa  65.5  5e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
219 aa  65.5  6e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
239 aa  65.1  6e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 
235 aa  65.1  7e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 
235 aa  64.7  8e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 
221 aa  64.7  9e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 
209 aa  64.3  1e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
220 aa  63.9  1e-09  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 
229 aa  64.3  1e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 
225 aa  63.2  2e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 
247 aa  63.2  2e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  31.05 
 
 
237 aa  63.5  2e-09  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  23.92 
 
 
222 aa  63.2  2e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  28.96 
 
 
203 aa  63.5  2e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1917  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
217 aa  63.2  3e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 
227 aa  62.8  4e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 
215 aa  62.8  4e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  23.83 
 
 
217 aa  62.8  4e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
215 aa  62.4  5e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  26.64 
 
 
220 aa  62.4  5e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  27.89 
 
 
237 aa  62  6e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 
221 aa  60.8  1e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  27.14 
 
 
212 aa  60.8  1e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  25.46 
 
 
222 aa  61.2  1e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  23.33 
 
 
233 aa  60.1  2e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
215 aa  60.5  2e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  29.63 
 
 
218 aa  59.3  3e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 
248 aa  59.7  3e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 
215 aa  59.3  3e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>