156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3658 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  100 
 
 		 111 aa  228  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  68.93 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  72.92 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  64.36 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  56.73 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  58.59 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  55.45 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  56.86 
 
 		 105 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  58.76 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  54.9 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  54.9 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  58.82 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  57.28 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  53.12 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  53 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  52.08 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  52.13 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  50 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  53.61 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  42.86 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  57.45 
 
 		 118 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  50 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  53.12 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  45.71 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  45.1 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  47.62 
 
 		 122 aa  92.8  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  44.55 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  45.26 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  38.89 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  32.63 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  34.74 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  35.35 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  36.67 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  32.35 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  34.38 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  34.38 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  34.38 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  39.13 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  27.72 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2432  hypothetical protein  35.87 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.30839  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  32.26 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  35.56 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0534  hypothetical protein  32.95 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  34.44 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  34.44 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  32.35 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  34.65 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  32.67 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  32.63 
 
 		 104 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3141  hypothetical protein  40.22 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  32.98 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  32.32 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  34.12 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1890  hypothetical protein  30.21 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3836  hypothetical protein  30.39 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3948  hypothetical protein  30.39 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.913691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3922  hypothetical protein  30.39 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  34.12 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0448  protein of unknown function DUF485  30.34 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0149641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0464  protein of unknown function DUF485  30.34 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22340  hypothetical protein  29.17 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000829166 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3878  hypothetical protein  40.22 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280009  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  34.04 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1117  hypothetical protein  29 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.130739  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03253  hypothetical protein  30.1 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  31.87 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  31.87 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  31.87 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  41.3 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  31.11 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  31.11 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4669  hypothetical protein  31.11 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  31.11 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  31.11 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1981  hypothetical protein  28.42 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0888  protein of unknown function DUF485  31.58 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  32.94 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  32.35 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  32.94 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  32.97 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  32.97 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  29.29 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3842  protein of unknown function DUF485  28.72 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963059  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3702  hypothetical protein  28.72 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3759  protein of unknown function DUF485  28.72 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0555  protein of unknown function DUF485  31.58 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.365765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1020  protein of unknown function DUF485  32.53 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.104425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  31.52 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03940  conserved inner membrane protein involved in acetate transport  28.87 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3924  protein of unknown function DUF485  28.87 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1541  protein of unknown function DUF485  30.11 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000112878  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4011  hypothetical protein  32.61 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  28.87 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  28.87 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03900  hypothetical protein  28.87 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  28.87 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4530  hypothetical protein  28.87 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5573  hypothetical protein  28.87 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4587  hypothetical protein  28.87 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>