More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0446 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
336 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2950  protein of unknown function DUF21  70.54 
 
 
341 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  65.26 
 
 
342 aa  414  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2794  protein of unknown function DUF21  62.39 
 
 
340 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  57.66 
 
 
333 aa  355  5e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3860  protein of unknown function DUF21  59.63 
 
 
350 aa  344  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00358184  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0016  protein of unknown function DUF21  53.94 
 
 
334 aa  338  8e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.430522  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  53.25 
 
 
340 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0319  protein of unknown function DUF21  52.23 
 
 
342 aa  329  4e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000713194  normal  0.0140808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3478  hypothetical protein  54.49 
 
 
332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3541  hypothetical protein  54.49 
 
 
332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3491  hypothetical protein  54.49 
 
 
332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648386  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2682  hypothetical protein  55.56 
 
 
332 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  52.94 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3861  hypothetical protein  56.29 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3114  hypothetical protein  49.11 
 
 
345 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  44.24 
 
 
344 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  42.34 
 
 
354 aa  229  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  42.34 
 
 
354 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  43.04 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  42.45 
 
 
337 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  40.77 
 
 
353 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  42.6 
 
 
337 aa  205  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  38.87 
 
 
358 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  37.09 
 
 
347 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  37.74 
 
 
346 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  35.1 
 
 
346 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  35.14 
 
 
348 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  36.84 
 
 
351 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  36.84 
 
 
351 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  36.84 
 
 
351 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  38.87 
 
 
366 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  36.56 
 
 
348 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  35.47 
 
 
353 aa  176  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  38.34 
 
 
365 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  33.91 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  32.42 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  34.81 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  35.12 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  33.23 
 
 
437 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  38.84 
 
 
355 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  34.36 
 
 
346 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  30.24 
 
 
444 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  36.25 
 
 
351 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  34.68 
 
 
357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  32.73 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  36.99 
 
 
352 aa  163  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  33.43 
 
 
358 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  30.28 
 
 
432 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  29.48 
 
 
448 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 
361 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  30.28 
 
 
432 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  30.28 
 
 
432 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.3 
 
 
432 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 
361 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  34.74 
 
 
349 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.3 
 
 
425 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  29.55 
 
 
437 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  29.7 
 
 
432 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  28 
 
 
435 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  28 
 
 
435 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  28 
 
 
435 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  28.84 
 
 
435 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  33.44 
 
 
461 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  30.58 
 
 
432 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  28 
 
 
435 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  34.05 
 
 
345 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  29.94 
 
 
446 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  28.31 
 
 
435 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  34.23 
 
 
355 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  28.31 
 
 
435 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 
435 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 
435 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  28.53 
 
 
435 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  29.57 
 
 
441 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  31.06 
 
 
439 aa  156  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  29.39 
 
 
432 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  30.21 
 
 
446 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  27.3 
 
 
446 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  35.03 
 
 
365 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  29.25 
 
 
440 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  29.25 
 
 
440 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  30.15 
 
 
442 aa  152  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.4 
 
 
442 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 
442 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  32.44 
 
 
438 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48540  hypothetical protein  33.73 
 
 
463 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0608303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  36.42 
 
 
376 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  30.15 
 
 
442 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  29.85 
 
 
442 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  34.24 
 
 
444 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  30.15 
 
 
442 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  29.55 
 
 
442 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  27.81 
 
 
446 aa  150  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  29.55 
 
 
442 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 
442 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  31.03 
 
 
446 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  28.75 
 
 
435 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  27.27 
 
 
428 aa  149  9e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>