23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0035 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0035  putative integral membrane protein  100 
 
 		 236 aa  447  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.995493  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  50.24 
 
 		 237 aa  128  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.18 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  35.59 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.02 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.24 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.33 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.41 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  27.75 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.22 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.89 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.15 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.43 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.11 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  30.2 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.86 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  34.8 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.87 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.09 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  32.35 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.09 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.84 
 
 		 269 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.03 
 
 		 291 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>