More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2370 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
355 aa  711    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  59.22 
 
 
357 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  59.16 
 
 
346 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  56.94 
 
 
347 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  52.07 
 
 
348 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  51.01 
 
 
346 aa  333  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  52.15 
 
 
355 aa  330  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  51.87 
 
 
349 aa  330  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  50.28 
 
 
365 aa  322  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  50 
 
 
346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  50.76 
 
 
347 aa  293  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  45.93 
 
 
346 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  46.51 
 
 
346 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  46.99 
 
 
376 aa  285  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  44.51 
 
 
356 aa  282  7.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  44.75 
 
 
357 aa  278  8e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  41.27 
 
 
358 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  43.26 
 
 
356 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  47.13 
 
 
366 aa  268  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  45.71 
 
 
365 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  42.74 
 
 
353 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  42.57 
 
 
348 aa  258  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  41.57 
 
 
353 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  41.72 
 
 
351 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  41.72 
 
 
351 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  41.72 
 
 
351 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  42.17 
 
 
351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  44.15 
 
 
352 aa  251  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  41.19 
 
 
335 aa  242  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  41.64 
 
 
345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  34.34 
 
 
439 aa  208  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  37.99 
 
 
353 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  38.55 
 
 
344 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  37.88 
 
 
354 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  37.05 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  34.43 
 
 
430 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  34.02 
 
 
443 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  31.61 
 
 
449 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  34.63 
 
 
446 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  31.61 
 
 
449 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  31.14 
 
 
428 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  38.14 
 
 
337 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  32.95 
 
 
446 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  36.64 
 
 
433 aa  189  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  33.98 
 
 
486 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  37.24 
 
 
358 aa  188  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  33.43 
 
 
437 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  33.52 
 
 
431 aa  185  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  29.14 
 
 
449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.86 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  29.26 
 
 
445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  35.09 
 
 
337 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 
455 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  29.6 
 
 
446 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.06 
 
 
442 aa  180  4e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  32.36 
 
 
437 aa  180  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  32.73 
 
 
451 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1725  hypothetical protein  32.58 
 
 
440 aa  179  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  36.75 
 
 
474 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  35.24 
 
 
503 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0022  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.88 
 
 
442 aa  176  8e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  30.84 
 
 
456 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  32.95 
 
 
520 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  28.65 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  36.34 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  32.73 
 
 
464 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  30.35 
 
 
444 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  30.43 
 
 
440 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  32.38 
 
 
574 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  30.72 
 
 
442 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  33.14 
 
 
471 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  33.14 
 
 
471 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
442 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  30.72 
 
 
440 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  31.07 
 
 
490 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  33.14 
 
 
470 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  32.24 
 
 
496 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  30.14 
 
 
442 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  30.12 
 
 
442 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  29.28 
 
 
435 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  29.28 
 
 
435 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  30.14 
 
 
442 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  29.28 
 
 
435 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  29.28 
 
 
435 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  33.53 
 
 
460 aa  170  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  29.86 
 
 
442 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  29.86 
 
 
442 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  32.02 
 
 
451 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  33.43 
 
 
453 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 
435 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  28.7 
 
 
435 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  33.13 
 
 
450 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  31.98 
 
 
361 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  28.99 
 
 
435 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 
442 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  31.98 
 
 
361 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  28.99 
 
 
435 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  28.7 
 
 
435 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  31.98 
 
 
432 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  34.4 
 
 
444 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>