More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0971 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  100 
 
 
463 aa  919    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  65.25 
 
 
466 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  60.36 
 
 
461 aa  491  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  61.54 
 
 
468 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2567  FolC bifunctional protein  53.32 
 
 
477 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  55.98 
 
 
526 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  52.46 
 
 
460 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  50.55 
 
 
470 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  50 
 
 
508 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  53.78 
 
 
450 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  52.38 
 
 
440 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  52.24 
 
 
447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  49.89 
 
 
452 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  48.52 
 
 
471 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7289  FolC bifunctional protein  51.72 
 
 
515 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  52.16 
 
 
443 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  53.69 
 
 
468 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  49 
 
 
452 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  50.69 
 
 
452 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  50 
 
 
462 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  46.84 
 
 
485 aa  386  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  49.89 
 
 
444 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1469  FolC bifunctional protein  49.78 
 
 
471 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0493364  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  45.95 
 
 
543 aa  385  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  47.52 
 
 
464 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  50.47 
 
 
444 aa  378  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  49.21 
 
 
515 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  53.28 
 
 
448 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  48.58 
 
 
487 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  50.56 
 
 
445 aa  363  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  48.94 
 
 
448 aa  361  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3562  FolC bifunctional protein  49.89 
 
 
467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.523756  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3557  FolC bifunctional protein  49.67 
 
 
467 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.011361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3630  FolC bifunctional protein  49.67 
 
 
467 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.299484 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  47.99 
 
 
517 aa  334  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2631  FolC bifunctional protein  47.15 
 
 
471 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0121718  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3950  FolC bifunctional protein  46.45 
 
 
471 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  39.67 
 
 
429 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  35.13 
 
 
431 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  35.1 
 
 
443 aa  239  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  37.35 
 
 
440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  37.32 
 
 
431 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.83 
 
 
459 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  36.21 
 
 
426 aa  229  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.75 
 
 
431 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  33.73 
 
 
416 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  38.06 
 
 
445 aa  227  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  35.81 
 
 
441 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  36.09 
 
 
441 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.43 
 
 
435 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.43 
 
 
437 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  37.07 
 
 
424 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  38.1 
 
 
437 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  37.77 
 
 
438 aa  223  7e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.25 
 
 
466 aa  222  9e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  32.24 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  32.86 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  37.17 
 
 
439 aa  219  8.999999999999998e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  36.07 
 
 
424 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  34.26 
 
 
424 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.09 
 
 
433 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  31.92 
 
 
431 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  32.09 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  33.65 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  32.18 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  35.92 
 
 
424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  36.3 
 
 
424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  31.86 
 
 
433 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  31.86 
 
 
433 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  31.86 
 
 
433 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  34.59 
 
 
447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  36.49 
 
 
453 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  36.47 
 
 
437 aa  213  7e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.09 
 
 
433 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  28.67 
 
 
413 aa  211  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  39.75 
 
 
425 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  33.81 
 
 
428 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  31.68 
 
 
438 aa  211  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  31.86 
 
 
433 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.52 
 
 
434 aa  209  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2653  FolC bifunctional protein  36.06 
 
 
422 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.768259  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1821  FolC bifunctional protein  36.87 
 
 
428 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.63 
 
 
433 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  30.77 
 
 
433 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  31.4 
 
 
433 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  33.57 
 
 
435 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  33.25 
 
 
404 aa  206  9e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  35.96 
 
 
433 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  32.46 
 
 
428 aa  205  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
425 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  32.46 
 
 
425 aa  202  7e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  35.93 
 
 
438 aa  202  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  35.36 
 
 
454 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  31.52 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  30.6 
 
 
465 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32.1 
 
 
438 aa  200  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  35.73 
 
 
878 aa  200  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  36.36 
 
 
381 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.7 
 
 
433 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  32.49 
 
 
433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>