45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0055 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0055    100 
 
 		 2195 bp  4351    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2924  Catalase  82.54 
 
 		 2202 bp  165  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0605396  normal  0.825908 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5439  catalase  80.88 
 
 		 2235 bp  119  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.441674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5148  catalase  79.94 
 
 		 2235 bp  119  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5060  catalase  79.94 
 
 		 2235 bp  119  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1094  catalase  86.32 
 
 		 2226 bp  105  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5310  Catalase  83.82 
 
 		 2109 bp  95.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1733  Catalase  79.44 
 
 		 2217 bp  93.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.027105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2517  Catalase  85.45 
 
 		 2268 bp  91.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.015736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  86.73 
 
 		 2163 bp  91.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00480  catalase  81.07 
 
 		 2070 bp  75.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.954008  normal  0.80551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  81.75 
 
 		 2073 bp  73.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6342  hydroperoxidase II  84.38 
 
 		 2109 bp  71.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31810  catalase  83.65 
 
 		 2217 bp  71.9  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  84.78 
 
 		 2151 bp  71.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02220  catalase  82.99 
 
 		 2220 bp  69.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  87.88 
 
 		 2109 bp  67.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.249149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4346  Catalase  87.88 
 
 		 2151 bp  67.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.202786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3446  catalase  89.47 
 
 		 2148 bp  65.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0935756  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2273  hydroperoxidase II  87.69 
 
 		 2142 bp  65.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878038  hitchhiker  0.00653218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4585  Catalase  80.54 
 
 		 2109 bp  65.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2782  Catalase  86.76 
 
 		 1485 bp  63.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  86.76 
 
 		 2406 bp  63.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  93.18 
 
 		 2130 bp  63.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  80 
 
 		 2130 bp  63.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  85.14 
 
 		 2175 bp  60  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3078  catalase  82.65 
 
 		 1500 bp  60  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  86.15 
 
 		 2130 bp  58  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  81.7 
 
 		 2148 bp  58  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2202  catalase  83.75 
 
 		 2247 bp  56  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22460  catalase  83.33 
 
 		 1500 bp  56  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  84.51 
 
 		 1542 bp  54  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  89.36 
 
 		 2262 bp  54  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  89.36 
 
 		 1668 bp  54  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  87.27 
 
 		 2187 bp  54  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  86.44 
 
 		 2124 bp  54  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0130  hydroperoxidase II  82.56 
 
 		 2136 bp  52  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14080  catalase  80.33 
 
 		 2289 bp  52  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  84.85 
 
 		 2259 bp  52  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3732  Catalase  87.04 
 
 		 2118 bp  52  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  82.02 
 
 		 2127 bp  50.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  90.24 
 
 		 2139 bp  50.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  88.89 
 
 		 1998 bp  50.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  82.02 
 
 		 2127 bp  50.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  88.89 
 
 		 1986 bp  50.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>