More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2348 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  100 
 
 
572 aa  1105    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  44.67 
 
 
590 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  43.53 
 
 
588 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  45.7 
 
 
591 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  43.33 
 
 
585 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  41.89 
 
 
574 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  44.95 
 
 
586 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  37.94 
 
 
574 aa  363  6e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  42.31 
 
 
585 aa  355  8.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  41.67 
 
 
592 aa  354  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  40.98 
 
 
605 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  44.01 
 
 
558 aa  348  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  38.53 
 
 
560 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  38.48 
 
 
571 aa  343  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  42.31 
 
 
588 aa  339  7e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  39.64 
 
 
583 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  43.24 
 
 
584 aa  334  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  37.81 
 
 
578 aa  333  5e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  36.77 
 
 
588 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  36.05 
 
 
568 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  36.05 
 
 
568 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  36.05 
 
 
568 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  34.34 
 
 
597 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  36.1 
 
 
578 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  35.51 
 
 
573 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  35.53 
 
 
565 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  35.33 
 
 
580 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  36.59 
 
 
588 aa  299  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  32.48 
 
 
569 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  32.48 
 
 
569 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  39.44 
 
 
566 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  37.59 
 
 
571 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  35.81 
 
 
575 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  35.99 
 
 
575 aa  292  9e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  35.9 
 
 
573 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  34.04 
 
 
603 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  35.81 
 
 
584 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  36.11 
 
 
590 aa  282  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  34.67 
 
 
583 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  32.93 
 
 
626 aa  282  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  35.02 
 
 
579 aa  281  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  33.83 
 
 
596 aa  280  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  33.94 
 
 
570 aa  279  8e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  37.21 
 
 
605 aa  279  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  33.85 
 
 
573 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  34.39 
 
 
570 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  38.22 
 
 
582 aa  276  6e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  33.65 
 
 
574 aa  276  9e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  33.4 
 
 
570 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  34.81 
 
 
577 aa  273  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  32.83 
 
 
570 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  37.75 
 
 
557 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  37.5 
 
 
559 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  35.35 
 
 
582 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  33.02 
 
 
570 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  31.11 
 
 
608 aa  269  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  35.93 
 
 
576 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  34.83 
 
 
576 aa  267  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  34.94 
 
 
565 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  33.64 
 
 
595 aa  266  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  35.62 
 
 
572 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  35.03 
 
 
730 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  35.21 
 
 
585 aa  265  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  34.86 
 
 
610 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.04 
 
 
610 aa  264  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.04 
 
 
610 aa  264  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  33.98 
 
 
585 aa  263  8e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  34.86 
 
 
610 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.86 
 
 
610 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.86 
 
 
610 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.86 
 
 
610 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  34.18 
 
 
585 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  36.78 
 
 
581 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  32.54 
 
 
586 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  36.13 
 
 
574 aa  258  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  35.18 
 
 
563 aa  258  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  37.24 
 
 
587 aa  257  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  33.98 
 
 
585 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  33.79 
 
 
585 aa  257  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  35.04 
 
 
592 aa  256  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  36.65 
 
 
571 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  32.9 
 
 
711 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  32.82 
 
 
585 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  32.82 
 
 
585 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  32.82 
 
 
585 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  32.82 
 
 
585 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  35.03 
 
 
590 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  36.04 
 
 
586 aa  253  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  33.4 
 
 
590 aa  250  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  34.84 
 
 
592 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  32.77 
 
 
703 aa  250  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  34.18 
 
 
600 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  32.68 
 
 
567 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  31.65 
 
 
703 aa  248  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  36.29 
 
 
574 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  36.76 
 
 
576 aa  243  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  33.39 
 
 
569 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  33.47 
 
 
578 aa  240  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  29.31 
 
 
591 aa  240  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  31.75 
 
 
620 aa  239  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>