47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1420 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  100 
 
 
338 aa  700    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  57.27 
 
 
342 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  50.91 
 
 
339 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  49.39 
 
 
339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  38.36 
 
 
345 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  37.93 
 
 
346 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  37.39 
 
 
348 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  37.21 
 
 
341 aa  202  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  38.12 
 
 
348 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  36.13 
 
 
338 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  36.13 
 
 
338 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  37.95 
 
 
326 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  34.29 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  35.67 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  36.34 
 
 
338 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  34.68 
 
 
368 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  36.04 
 
 
338 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  33.63 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  33.12 
 
 
347 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  31.6 
 
 
337 aa  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  32.93 
 
 
359 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  36.14 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  31.44 
 
 
346 aa  162  1e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  33.13 
 
 
327 aa  160  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  32.08 
 
 
332 aa  159  9e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  32.49 
 
 
355 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  28.35 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5493  hypothetical protein  27.43 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  28.41 
 
 
314 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  26.67 
 
 
327 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  24.64 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  27.45 
 
 
329 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  41.77 
 
 
187 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  45.1 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  24.18 
 
 
313 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5328  hypothetical protein  38.96 
 
 
83 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  34.82 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  34.82 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  23.44 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  42.62 
 
 
247 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  25.32 
 
 
267 aa  46.2  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  36.59 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  45.1 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  36.56 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  34.57 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  42.62 
 
 
246 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  51.06 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>