75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1109 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1109  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 284 aa  570  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1707  uroporphyrinogen III synthase HEM4  48.31 
 
 		 281 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752477 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0672  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  48.31 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4165  uroporphyrinogen III synthase HEM4  43.61 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5710  putative uroporphyrinogen-III synthase  39.47 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4563  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.64 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1576  uroporphyrinogen III synthase HEM4  39.25 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2963  uroporphyrinogen III synthase HEM4  43.56 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.46 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.46 
 
 		 372 aa  99  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1303  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.45 
 
 		 387 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000592794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1256  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.37 
 
 		 387 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.89 
 
 		 390 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000187789  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.89 
 
 		 381 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2282  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.11 
 
 		 419 aa  85.9  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000232035  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  28.93 
 
 		 389 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10264  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.3 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.122536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  28.36 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.26 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1775  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.78 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.83 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.57 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000157223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.86 
 
 		 391 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000567169  hitchhiker  0.00000562153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3505  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.15 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.52 
 
 		 380 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.29 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.3 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  26.95 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  26.95 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  26.95 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4262  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  27.49 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  27.24 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3871  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  26.8 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1526  uroporphyrinogen-III synthase  28.29 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000060174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.69 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.21 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  27.67 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  26.67 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.12 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0052  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.89 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0354  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  27.67 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1458  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.64 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  25 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.49 
 
 		 491 aa  57  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1792  uroporphyrinogen-III synthase  24.46 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.156972  normal  0.974342 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.5 
 
 		 435 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.09 
 
 		 512 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.06 
 
 		 509 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  23.94 
 
 		 513 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  27.1 
 
 		 513 aa  52.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2393  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.91 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0493  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.24 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.64 
 
 		 512 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10522  uroporphyrin-III C-methyltransferase hemD  40.7 
 
 		 565 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  26.34 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.22 
 
 		 492 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  23.55 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4578  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.55 
 
 		 516 aa  45.8  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1106  uroporphyrinogen-III synthase  37.63 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000478387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.91 
 
 		 519 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.21 
 
 		 571 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.99 
 
 		 507 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.25 
 
 		 511 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0065  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.21 
 
 		 569 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255039  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0691  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.21 
 
 		 554 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  37.21 
 
 		 577 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0671  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.21 
 
 		 554 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0678  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.21 
 
 		 554 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  25.17 
 
 		 513 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  37.21 
 
 		 516 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.08 
 
 		 510 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0669  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  36.14 
 
 		 567 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.52 
 
 		 503 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  23.68 
 
 		 503 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.08 
 
 		 511 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>