38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2402 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2402  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 466 aa  889    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1507  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  53.3 
 
 		 445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1905  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  52.09 
 
 		 415 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2426  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  49.73 
 
 		 464 aa  297  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0719  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  46.37 
 
 		 423 aa  250  5e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.54 
 
 		 1343 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  32.86 
 
 		 1224 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.83 
 
 		 208 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  36.28 
 
 		 1094 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  34.92 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.71 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  33.74 
 
 		 493 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.62 
 
 		 524 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.3 
 
 		 192 aa  53.5  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.96 
 
 		 1139 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.51 
 
 		 510 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  33.63 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.74 
 
 		 180 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  31.5 
 
 		 1148 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  26.53 
 
 		 958 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  34.26 
 
 		 250 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1181 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.51 
 
 		 221 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.61 
 
 		 176 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  29.01 
 
 		 644 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.92 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.13 
 
 		 223 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  27.18 
 
 		 1143 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  31.75 
 
 		 1133 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.86 
 
 		 214 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  35 
 
 		 200 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.34 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.61 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  31.86 
 
 		 250 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  30.22 
 
 		 546 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.3 
 
 		 1328 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3723  HEAT domain containing protein  30.56 
 
 		 249 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.39 
 
 		 302 aa  43.5  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>