More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0842 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  56.1 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  41.18 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  40.71 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  35.71 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  38.97 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  34.72 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  35.04 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  38.97 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  38.41 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  35.37 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  39.85 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  38.35 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  36.64 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  36.64 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  39.1 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  32.65 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  32.65 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  31.97 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  36.15 
 
 		 176 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  35.71 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  37.01 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  37.06 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  34.33 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  31.33 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  36.22 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  36.22 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  37.5 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  37.01 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  37.5 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  37.01 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  37.01 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  37.5 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  37.01 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  37.8 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  36.22 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  34.29 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  33.57 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  35.21 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  36.76 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  37.32 
 
 		 151 aa  84.3  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  35.43 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  29.92 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  37.01 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  30.71 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  37.8 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1649  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0556503  hitchhiker  0.00120732 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  32.62 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  29.5 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  31.08 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  37.01 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  33.8 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  33.8 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  33.8 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  33.8 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  33.8 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  33.8 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  33.8 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  37.01 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  37.01 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  33.8 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  33.8 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  27.14 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  35.97 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  34.29 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  35.25 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  34.29 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  35.16 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  25.4 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  34.65 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  35.25 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  36.22 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  28.03 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  35 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  35 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  35.54 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  35.54 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3895  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.845515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  31.11 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  28.03 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  28.03 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0593  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.211078  unclonable  0.00000627235 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  28.67 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  35.11 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  26.76 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  36.36 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  34.31 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  33.62 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>