More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4018 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
259 aa  507  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  77.37 
 
 
252 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  76.05 
 
 
243 aa  362  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  75.72 
 
 
270 aa  359  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  76.54 
 
 
257 aa  352  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  78.15 
 
 
271 aa  347  8e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  67.05 
 
 
264 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  70.25 
 
 
246 aa  341  8e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  74.49 
 
 
253 aa  341  9e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  72.88 
 
 
242 aa  332  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  70.21 
 
 
244 aa  322  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  64.29 
 
 
246 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  62.45 
 
 
250 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  63.03 
 
 
258 aa  295  4e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  64.75 
 
 
251 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  65.97 
 
 
247 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  65.97 
 
 
247 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  62.77 
 
 
256 aa  274  9e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  56.78 
 
 
259 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  56.22 
 
 
266 aa  259  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 
249 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  54.7 
 
 
252 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  56.85 
 
 
252 aa  245  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.64 
 
 
250 aa  241  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  54.08 
 
 
249 aa  240  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  53.65 
 
 
249 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  48.29 
 
 
254 aa  234  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.73 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  52.36 
 
 
270 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.96 
 
 
278 aa  229  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
395 aa  229  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
255 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 
278 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 
281 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 
281 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.73 
 
 
255 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  45.23 
 
 
398 aa  222  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  47.03 
 
 
255 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.52 
 
 
273 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  46.61 
 
 
255 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  51.72 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 
283 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.33 
 
 
288 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.15 
 
 
277 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.76 
 
 
276 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 
402 aa  217  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  42.49 
 
 
240 aa  214  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
403 aa  214  9e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 
411 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.48 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
440 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 
284 aa  211  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 
281 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 
277 aa  209  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
456 aa  208  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 
453 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  43.39 
 
 
284 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.26 
 
 
285 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.84 
 
 
277 aa  207  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  42.86 
 
 
239 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.17 
 
 
541 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.84 
 
 
285 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  44.49 
 
 
282 aa  206  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  54.01 
 
 
270 aa  205  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  39.33 
 
 
283 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.12 
 
 
310 aa  204  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.51 
 
 
284 aa  202  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.66 
 
 
276 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  37.55 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.55 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.09 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  42.56 
 
 
380 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  41.2 
 
 
239 aa  193  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  39.83 
 
 
244 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1807  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.31 
 
 
256 aa  191  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.84 
 
 
243 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.17 
 
 
274 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.41 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  40.61 
 
 
287 aa  189  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.49 
 
 
277 aa  188  8e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  42.97 
 
 
291 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  44.35 
 
 
278 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  43.46 
 
 
568 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  40.08 
 
 
283 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  40.08 
 
 
283 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.93 
 
 
305 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  46.9 
 
 
571 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.24 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  37.92 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.92 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.67 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  40.89 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.32 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.16 
 
 
244 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  41.13 
 
 
278 aa  182  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 
630 aa  181  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 
403 aa  182  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.29 
 
 
286 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 
282 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>