158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0898 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  36.4 
 
 
319 aa  130  2e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  39.82 
 
 
259 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  35.55 
 
 
284 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  31.72 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  35.16 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  35.16 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  32.51 
 
 
313 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  33.46 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  33.46 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  32.27 
 
 
296 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  37.08 
 
 
289 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  35.91 
 
 
357 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  32.57 
 
 
278 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  32.57 
 
 
277 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  31.88 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  31.88 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  28.71 
 
 
314 aa  84.7  1e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  32.14 
 
 
291 aa  84.7  2e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  45 
 
 
295 aa  84.3  2e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6926e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  33.21 
 
 
294 aa  84.3  2e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  33.08 
 
 
300 aa  84  3e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  33.08 
 
 
300 aa  83.2  5e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  33.08 
 
 
300 aa  83.2  5e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  33.88 
 
 
320 aa  81.6  1e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  33.88 
 
 
320 aa  81.6  1e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  28.83 
 
 
307 aa  81.3  2e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  34.44 
 
 
289 aa  80.9  2e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  34.21 
 
 
284 aa  80.9  2e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  31.67 
 
 
286 aa  80.5  3e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  31.67 
 
 
286 aa  80.5  3e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  33.63 
 
 
290 aa  79.7  6e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  32.98 
 
 
288 aa  79.3  6e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  30.8 
 
 
289 aa  79.7  6e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  33.63 
 
 
290 aa  79.7  6e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  33.63 
 
 
290 aa  79.7  6e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  32.79 
 
 
306 aa  78.6  1e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  44.76 
 
 
298 aa  78.6  1e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  30.97 
 
 
283 aa  78.2  1e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  33.83 
 
 
284 aa  77.8  2e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  33.83 
 
 
284 aa  77.8  2e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  32 
 
 
293 aa  77  3e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  33.06 
 
 
289 aa  76.6  4e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  35.59 
 
 
267 aa  76.6  4e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  36.52 
 
 
320 aa  76.6  5e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  36.52 
 
 
320 aa  76.6  5e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  36.52 
 
 
320 aa  76.6  5e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  34.76 
 
 
309 aa  76.3  5e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  34.3 
 
 
379 aa  75.9  7e-13  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  33.58 
 
 
281 aa  75.9  7e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  33.58 
 
 
281 aa  75.9  7e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  31.3 
 
 
279 aa  75.9  7e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  3.00083e-06 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  37.19 
 
 
330 aa  75.5  9e-13  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  42.86 
 
 
289 aa  74.7  2e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  31.36 
 
 
294 aa  74.7  2e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  33.58 
 
 
281 aa  74.7  2e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  31.7 
 
 
291 aa  73.9  3e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  29.89 
 
 
307 aa  73.9  3e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  31.7 
 
 
291 aa  73.9  3e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4722  hypothetical protein  32.81 
 
 
317 aa  73.6  4e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  33.62 
 
 
289 aa  72.4  7e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1237  hypothetical protein  34.02 
 
 
307 aa  72.4  9e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0019  hypothetical protein  34.19 
 
 
317 aa  71.2  2e-11  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0256854  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  31.09 
 
 
347 aa  71.2  2e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  31.58 
 
 
335 aa  70.5  3e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  40.35 
 
 
261 aa  70.1  4e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  70.1  4e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  32.23 
 
 
301 aa  70.1  4e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  35.47 
 
 
311 aa  69.3  7e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0068  hypothetical protein  40.62 
 
 
276 aa  68.6  1e-10  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  31.97 
 
 
288 aa  68.6  1e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  37.29 
 
 
262 aa  68.9  1e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1395  hypothetical protein  28.08 
 
 
328 aa  68.2  2e-10  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0744184  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31030  hypothetical protein  31.6 
 
 
291 aa  67.8  2e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  29.76 
 
 
289 aa  66.6  4e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  36.05 
 
 
306 aa  67  4e-10  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  33.07 
 
 
302 aa  66.6  5e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  28.69 
 
 
302 aa  66.2  6e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.6316e-11 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  34.04 
 
 
424 aa  65.9  8e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  31.58 
 
 
306 aa  65.5  9e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1754  hypothetical protein  34.48 
 
 
299 aa  64.7  2e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.133696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  31.25 
 
 
294 aa  64.7  2e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  37.79 
 
 
306 aa  63.5  3e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  42.72 
 
 
329 aa  63.9  3e-09  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  34.9 
 
 
303 aa  63.5  3e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  29.78 
 
 
319 aa  63.5  4e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  32.67 
 
 
320 aa  63.2  5e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  33.06 
 
 
321 aa  63.2  5e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  28.78 
 
 
294 aa  62.8  7e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  30.54 
 
 
297 aa  62  1e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  30.85 
 
 
347 aa  61.6  1e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  35.12 
 
 
285 aa  62  1e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  35.81 
 
 
297 aa  62  1e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  38.17 
 
 
335 aa  61.2  2e-08  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  32.35 
 
 
374 aa  60.8  3e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4708  hypothetical protein  30.27 
 
 
301 aa  60.1  4e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  34.76 
 
 
270 aa  60.1  4e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  29.86 
 
 
319 aa  59.3  8e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1533  hypothetical protein  28.4 
 
 
302 aa  58.9  9e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.837222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  29.44 
 
 
321 aa  58.9  1e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>