285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1364 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  100 
 
 		 58 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 58 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  49.12 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000859668  hitchhiker  0.00000207421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2306  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  51.92 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  62  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3891  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000029695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  47.37 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  51.92 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0515  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181031  unclonable  0.0000000000137591 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0345  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0341  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260811  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06430  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4225  ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00829354  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 58 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1084  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  44.64 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0472  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291193  hitchhiker  0.00000269713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0502  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000122641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0505  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00113735  normal  0.0573997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0855  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09030  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0258453  normal  0.264293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  48.15 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5061  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000009319  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4731  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000152085  normal  0.600234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0355  50S ribosomal protein L30  47.06 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1836  50S ribosomal protein L30  47.06 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.279591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>