More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3466 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3466  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  256  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.12169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  63.87 
 
 		 121 aa  151  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  59.17 
 
 		 121 aa  146  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  59.17 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  59.66 
 
 		 121 aa  140  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  60.68 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  60.68 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  60.5 
 
 		 122 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  60.5 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2707  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  54.17 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 122 aa  117  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  47.9 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  46.67 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  47.01 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 123 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  44.92 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  45.3 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  45.83 
 
 		 122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  45.3 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  45 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  43.7 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  42.74 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 120 aa  105  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  46.15 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  41.03 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  42.74 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  42.37 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  41.67 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  40.52 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  41.94 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  41.67 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  45.3 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  42.62 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  41.88 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  47.01 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  41.88 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  44.44 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6982  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3007  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 120 aa  98.2  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1007  chemotaxis protein CheY  45.3 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  40.68 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1095  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  39.83 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0164  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498492 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1993  response regulator receiver  43.44 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.19 
 
 		 803 aa  94.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3587  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.794363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  39.83 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0181  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>