More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4546 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0781  heavy metal translocating P-type ATPase  62.52 
 
 
773 aa  815    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114633  decreased coverage  0.000689318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4550  heavy metal translocating P-type ATPase  65.3 
 
 
761 aa  899    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3699  heavy metal-transporting ATPase  66.71 
 
 
745 aa  869    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0922687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4018  heavy metal translocating P-type ATPase  65.27 
 
 
777 aa  859    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2501  heavy metal translocating P-type ATPase  54.25 
 
 
810 aa  706    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.792891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  59.5 
 
 
758 aa  771    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2848  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  67.82 
 
 
752 aa  834    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  65.47 
 
 
766 aa  886    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0536  heavy metal translocating P-type ATPase  63.94 
 
 
764 aa  794    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188836  normal  0.0794142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  64.87 
 
 
760 aa  847    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.879703  decreased coverage  0.00498444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  66.89 
 
 
737 aa  842    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  52.88 
 
 
868 aa  679    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  62.85 
 
 
785 aa  825    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646139  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5305  heavy metal translocating P-type ATPase  63.44 
 
 
782 aa  835    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.585321  normal  0.36068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5837  heavy metal translocating P-type ATPase  62.8 
 
 
733 aa  856    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0013  heavy metal translocating P-type ATPase  63.27 
 
 
745 aa  823    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0448  heavy metal translocating P-type ATPase  64.83 
 
 
763 aa  805    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189205  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  62.77 
 
 
737 aa  813    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  56.86 
 
 
850 aa  770    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.888341  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6538  heavy metal translocating P-type ATPase  64.26 
 
 
785 aa  791    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451318  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  49.2 
 
 
819 aa  651    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2769  heavy metal translocating P-type ATPase  53.4 
 
 
739 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0304144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3605  heavy metal translocating P-type ATPase  66.09 
 
 
765 aa  877    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0090  heavy metal translocating P-type ATPase  65.42 
 
 
764 aa  788    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  64.44 
 
 
757 aa  884    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  66.22 
 
 
737 aa  829    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  63.95 
 
 
769 aa  854    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0020  heavy metal-transporting ATPase  66.53 
 
 
746 aa  916    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.668167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  63.53 
 
 
762 aa  825    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  57.88 
 
 
867 aa  816    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8844  heavy metal translocating P-type ATPase  63.56 
 
 
764 aa  813    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  63.62 
 
 
782 aa  827    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0968777  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1452  heavy metal translocating P-type ATPase  65.69 
 
 
760 aa  864    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  62.77 
 
 
737 aa  813    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36160  copper/silver-translocating P-type ATPase  52.52 
 
 
847 aa  684    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735078  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19800  copper/silver-translocating P-type ATPase  64.96 
 
 
768 aa  815    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.139092  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
750 aa  1476    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36740  copper/silver-translocating P-type ATPase  63.04 
 
 
769 aa  817    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1679  heavy metal translocating P-type ATPase  59.57 
 
 
810 aa  776    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238517  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4240  heavy metal translocating P-type ATPase  63.03 
 
 
785 aa  825    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4099  heavy metal translocating P-type ATPase  54.59 
 
 
779 aa  716    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1901  heavy metal translocating P-type ATPase  66.23 
 
 
749 aa  889    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5747  heavy metal translocating P-type ATPase  65.74 
 
 
792 aa  872    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  60.85 
 
 
795 aa  800    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  66.44 
 
 
755 aa  931    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6798  heavy metal translocating P-type ATPase  60.7 
 
 
739 aa  739    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3788  heavy metal translocating P-type ATPase  61.9 
 
 
785 aa  771    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3873  heavy metal translocating P-type ATPase  55.15 
 
 
770 aa  660    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658121 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5704  heavy metal translocating P-type ATPase  63.44 
 
 
782 aa  834    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.563796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1470  heavy metal translocating P-type ATPase  65.69 
 
 
760 aa  864    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4022  heavy metal translocating P-type ATPase  62.77 
 
 
737 aa  813    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217745  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2618  heavy metal translocating P-type ATPase  49.27 
 
 
754 aa  615  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10093  cation transporter ATPase A ctpA  50.67 
 
 
761 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0081  heavy metal translocating P-type ATPase  51.47 
 
 
751 aa  611  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.768822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  43.03 
 
 
805 aa  588  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  44.03 
 
 
798 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10104  cation transporter ATPase B ctpB  50.72 
 
 
752 aa  590  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.5 
 
 
794 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  42.59 
 
 
815 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  43.43 
 
 
806 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  43.41 
 
 
797 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  42.76 
 
 
743 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  43.83 
 
 
837 aa  571  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
802 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  42.63 
 
 
805 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  42.63 
 
 
805 aa  565  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  42.63 
 
 
806 aa  565  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
802 aa  567  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  43.06 
 
 
806 aa  568  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  42.5 
 
 
805 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  42.5 
 
 
805 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  43.29 
 
 
753 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  42.5 
 
 
805 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  42.5 
 
 
805 aa  561  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  40.97 
 
 
828 aa  556  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  43.86 
 
 
750 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  43.82 
 
 
836 aa  556  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  45.21 
 
 
786 aa  555  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  41.49 
 
 
797 aa  549  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  43.43 
 
 
826 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  42.25 
 
 
759 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  42.25 
 
 
759 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  42.82 
 
 
798 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  42.01 
 
 
796 aa  545  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  42.82 
 
 
798 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  44.29 
 
 
838 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  44.66 
 
 
1087 aa  543  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  44.06 
 
 
840 aa  544  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  43.19 
 
 
752 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 
833 aa  544  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  43.52 
 
 
839 aa  541  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  42.49 
 
 
837 aa  539  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  50.87 
 
 
792 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  42.97 
 
 
821 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  42.69 
 
 
803 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  43.69 
 
 
841 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  45.25 
 
 
1071 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  40.34 
 
 
828 aa  538  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  42.76 
 
 
852 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  41.66 
 
 
817 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>