186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3906 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3906  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
170 aa  341  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4437  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  48.86 
 
 
172 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0979353  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0501  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  47.25 
 
 
181 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11302  hypothetical protein  46.11 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3936  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.47 
 
 
198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4010  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.47 
 
 
198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.461298  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3951  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  46.47 
 
 
198 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0128792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0780  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  47.86 
 
 
143 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2254  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  45.62 
 
 
200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0659  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.18 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0806  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.01 
 
 
175 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4970  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.14 
 
 
183 aa  101  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.31 
 
 
175 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4984  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.53 
 
 
183 aa  94.4  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277019  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1113  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.42 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0498  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.3 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03360  phosphohistidine phosphatase SixA  37.58 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.97 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  40.97 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.97 
 
 
155 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.18 
 
 
177 aa  85.1  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  35.92 
 
 
157 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2309  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.52 
 
 
168 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0322  putative phosphatase  37.13 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.629623  normal  0.448063 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0881  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.13 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00451478  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2320  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.28 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.825769  normal  0.76256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3058  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.42 
 
 
185 aa  80.5  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1094  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.42 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.175026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4118  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.71 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0361837  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.2 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0386  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398558  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.97 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.773586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0299  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.99 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0426  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.06 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.407898  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.99 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.21 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1480  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.62 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.474903  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2121  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.1 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88488  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0631  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.73 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1478  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.05 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.924383  normal  0.612523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15890  phosphohistidine phosphatase SixA  37.5 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0507958  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21760  phosphohistidine phosphatase SixA  37.18 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3559  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.29 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2863  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.47 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5540  hypothetical protein  34.03 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_004310  BR1035  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.45 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0420661  normal  0.240897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0059  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.88 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0689048  hitchhiker  0.00895006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0781  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.25 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1070  hypothetical protein  35.88 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1688  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.62 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2731  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.47 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542354  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0091  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.97 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0088  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.49 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.2 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.66 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4461  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.2 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1328  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35 
 
 
179 aa  63.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2363  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.32 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2469  hypothetical protein  28.93 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  30.67 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1896  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.99 
 
 
168 aa  62.4  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1528  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.63 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0539  phosphohistidine phosphatase  35.94 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0656  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.15 
 
 
166 aa  60.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.3 
 
 
183 aa  60.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.07 
 
 
157 aa  60.8  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0935  phosphoglycerate mutase family protein  32.9 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  36.36 
 
 
158 aa  58.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  34.75 
 
 
175 aa  58.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  28.95 
 
 
166 aa  58.2  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.94 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2408  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.12 
 
 
171 aa  57.8  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1730  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.77 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3504  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.43 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.04 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1965  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.37 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590219  normal  0.236004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2177  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.25 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210616  hitchhiker  0.00370879 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  33.55 
 
 
169 aa  55.1  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0224  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.14 
 
 
154 aa  54.7  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.4 
 
 
158 aa  54.3  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.91 
 
 
166 aa  54.3  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2573  phosphoglycerate mutase  34.71 
 
 
194 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370577  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0718  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.85 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.35 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.04 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  22.44 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14439  predicted protein  29.02 
 
 
193 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  29.57 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.07 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.15 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.65 
 
 
153 aa  47.8  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  31.82 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.73 
 
 
156 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.73 
 
 
156 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.73 
 
 
156 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>