37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2754 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2754  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  423  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00731615  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  62.09 
 
 
214 aa  241  8e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  58.17 
 
 
211 aa  226  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2831  urease accessory protein UreF  60.5 
 
 
211 aa  199  2e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2804  urease accessory protein UreF  60 
 
 
211 aa  196  2e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2848  urease accessory protein UreF  60 
 
 
211 aa  196  2e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3081  urease accessory protein UreF  59.24 
 
 
214 aa  188  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460127  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5698  urease accessory protein UreF  45.21 
 
 
244 aa  130  1e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244075  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0192  urease accessory protein UreF  39.61 
 
 
257 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0831  putative urease accessory protein  35.95 
 
 
265 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  39.56 
 
 
226 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3205  hypothetical protein  46.58 
 
 
221 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  34.93 
 
 
243 aa  89  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0505  hypothetical protein  41.55 
 
 
220 aa  79.7  3e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  37.06 
 
 
218 aa  65.5  6e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  22.41 
 
 
232 aa  63.2  3e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3408  putative urease accessory protein  40.57 
 
 
222 aa  62.8  4e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3505  Urease accessory protein UreF  32.44 
 
 
257 aa  59.3  4e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0273  Urease accessory protein UreF-like protein  30.28 
 
 
218 aa  58.2  8e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  31.2 
 
 
240 aa  56.6  2e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0696  Urease accessory protein UreF-like protein  33.15 
 
 
302 aa  55.5  6e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364387  unclonable  3.13783e-09 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  32.24 
 
 
218 aa  54.7  1e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  26.5 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  29.68 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  29.89 
 
 
288 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  20.98 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  27.11 
 
 
240 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  27.47 
 
 
237 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  23.79 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  23.79 
 
 
228 aa  45.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  23.35 
 
 
228 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  23.79 
 
 
228 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  27.57 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  27.39 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  42.59 
 
 
245 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  30 
 
 
240 aa  41.6  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  30 
 
 
240 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>