32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0192 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0192  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 257 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  45.49 
 
 		 214 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  41.96 
 
 		 211 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0831  putative urease accessory protein  46.77 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5698  urease accessory protein UreF  45.49 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2804  urease accessory protein UreF  43.15 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2848  urease accessory protein UreF  43.15 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2831  urease accessory protein UreF  43.15 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  41.13 
 
 		 226 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3081  urease accessory protein UreF  46.27 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2754  hypothetical protein  41.41 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00731615  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  37.88 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0505  hypothetical protein  42.01 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3505  Urease accessory protein UreF  38.79 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3408  putative urease accessory protein  30.59 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3205  hypothetical protein  72.09 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  25.65 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0273  Urease accessory protein UreF-like protein  38.62 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  22.03 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  24.81 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  28.29 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0696  Urease accessory protein UreF-like protein  32.23 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364387  unclonable  0.00000000313783 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  55.56 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  44.19 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  28.42 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  30.91 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  43.48 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  43.48 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  43.48 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  33.1 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  35.34 
 
 		 309 aa  42.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  25.94 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>