27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0831 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0831  putative urease accessory protein  100 
 
 		 265 aa  498  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5698  urease accessory protein UreF  60.52 
 
 		 244 aa  225  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  47.56 
 
 		 226 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0192  urease accessory protein UreF  45.25 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  42.39 
 
 		 214 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3205  hypothetical protein  48.37 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  38.27 
 
 		 211 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0505  hypothetical protein  42.68 
 
 		 220 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2831  urease accessory protein UreF  43.7 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2804  urease accessory protein UreF  47.69 
 
 		 211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2848  urease accessory protein UreF  47.69 
 
 		 211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  37.3 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3081  urease accessory protein UreF  40.91 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2754  hypothetical protein  36.78 
 
 		 216 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00731615  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3505  Urease accessory protein UreF  36.33 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  40.65 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0273  Urease accessory protein UreF-like protein  29.58 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  25.47 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  27.97 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  36.13 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  27.27 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  23.22 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3408  putative urease accessory protein  32.12 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  29.44 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  29.26 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  22.09 
 
 		 228 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  27.72 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>