19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3408 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3408  putative urease accessory protein  100 
 
 		 222 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0273  Urease accessory protein UreF-like protein  48.86 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0696  Urease accessory protein UreF-like protein  49.72 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364387  unclonable  0.00000000313783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  37.85 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  39.15 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3505  Urease accessory protein UreF  35.16 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  34.08 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2804  urease accessory protein UreF  41.03 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  33.77 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2831  urease accessory protein UreF  41.03 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2848  urease accessory protein UreF  41.03 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5698  urease accessory protein UreF  32.62 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2754  hypothetical protein  34.42 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00731615  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3081  urease accessory protein UreF  37.57 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0831  putative urease accessory protein  28.57 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3205  hypothetical protein  41 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0505  hypothetical protein  36.2 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  37.69 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  26.82 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>