90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2078 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2078  nitrogen fixation protein NifX  100 
 
 		 129 aa  270  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2140  nitrogen fixation protein NifX  95.35 
 
 		 129 aa  257  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3490  nitrogen fixation protein NifX  77.34 
 
 		 132 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1202  nitrogen fixation protein NifX  73.44 
 
 		 128 aa  207  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0634  nitrogen fixation protein NifX  70.4 
 
 		 128 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0671  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  68 
 
 		 127 aa  188  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2805  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifX  63.57 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3026  nitrogen fixation protein NifX  61.86 
 
 		 137 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2101  nitrogen fixation protein NifX  47.9 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3207  nitrogen fixation protein NifX  55.83 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6876  nitrogen fixation protein NifX  47.46 
 
 		 148 aa  116  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0093  nitrogen fixation protein NifX  45.04 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.071454  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1565  nitrogen fixation protein NifX  39.13 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1515  nitrogen fixation protein NifX  42.11 
 
 		 138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  43.22 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1233  nitrogen fixation protein NifX  42.11 
 
 		 138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802968 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2323  nitrogen fixation protein NifX  42.75 
 
 		 136 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0653956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2284  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  40.77 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4458  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  42.5 
 
 		 135 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1078  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  43.33 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1351  nitrogen fixation protein NifX  40.6 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3934  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  43.28 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0518816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0974  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  43.33 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649686  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1472  nitrogen fixation-related protein (NifX)  41.94 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437364  decreased coverage  0.0000979183 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  40 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3627  nitrogen fixation protein NifX  41.32 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4798  nitrogen fixation protein NifX  45.08 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5920  nitrogenase molybdenum-iron protein nifX  41.32 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5096  nitrogen fixation protein NifX  39.17 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4140  nitrogen fixation protein NifX  38.89 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01420  Nitrogenase iron molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.83 
 
 		 242 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  40.15 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2188  nitrogen fixation protein NifX  36.03 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1251  nitrogen fixation protein NifX  38.24 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7731  nitrogen fixation protein NifX  34.88 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0478  nitrogen fixation protein NifX  38.52 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  39.83 
 
 		 243 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2114  nitrogen fixation protein NifX  38.21 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0536  putative nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  34.81 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6221  nitrogen fixation protein NifX  31.43 
 
 		 165 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0270  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.19 
 
 		 247 aa  90.1  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3539  nitrogen fixation protein NifX  33.06 
 
 		 158 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.89885  decreased coverage  0.00377232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50910  Nitrogen fixation-related protein, gamma subunit  38.14 
 
 		 243 aa  87.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0585445  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1790  nitrogen fixation protein NifX  37.4 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1818  nitrogen fixation protein NifX  37.4 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1054  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.54 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1348  nitrogen fixation protein NifX  38.52 
 
 		 139 aa  84.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3991  nitrogen fixation protein NifX  32.26 
 
 		 163 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1058  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.06 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01480  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifX  33.09 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0460  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.28 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4052  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.59 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1198  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.77 
 
 		 227 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.127129  hitchhiker  0.000500892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0265  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1455  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.09 
 
 		 247 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0495  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.29 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1506  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.97 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.19 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02570  nitrogen fixation-related protein, vnfY  23.57 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0717484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2272  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.64496  normal  0.15097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0499  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  21.67 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.71 
 
 		 522 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.33 
 
 		 520 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0058  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.94 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0199747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  33.33 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.18 
 
 		 519 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1567  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.61 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0105  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.3 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.314032  normal  0.119899 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1796  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.3 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.04 
 
 		 527 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.95 
 
 		 464 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0631  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.9 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0665  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.25 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.482499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1359  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.68 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  29.76 
 
 		 479 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02740  nitrogenase biosynthetic protein vnfX  21.8 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1036  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.68 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  29.21 
 
 		 520 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.25 
 
 		 475 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0673  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.36 
 
 		 109 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.651625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  34.18 
 
 		 491 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2803  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  32.5 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2599  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.37 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187403  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.76 
 
 		 527 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.91 
 
 		 491 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2103  putative nitrogen fixation protein  29.87 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.33 
 
 		 418 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1404  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  29.89 
 
 		 529 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6871  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.39 
 
 		 655 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  29.67 
 
 		 468 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>