67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1054 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1054  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 
123 aa  254  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2101  nitrogen fixation protein NifX  40.83 
 
 
119 aa  98.2  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1202  nitrogen fixation protein NifX  38.02 
 
 
128 aa  89.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2805  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifX  42.98 
 
 
129 aa  88.6  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0634  nitrogen fixation protein NifX  35.83 
 
 
128 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0671  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  41.32 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3490  nitrogen fixation protein NifX  38.02 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2078  nitrogen fixation protein NifX  35.54 
 
 
129 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2140  nitrogen fixation protein NifX  37.7 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0495  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.6 
 
 
220 aa  84.3  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  37.9 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.06 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5096  nitrogen fixation protein NifX  37.82 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2284  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.66 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1078  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.97 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0974  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.97 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649686  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1351  nitrogen fixation protein NifX  37.5 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4458  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.82 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0478  nitrogen fixation protein NifX  35.11 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6876  nitrogen fixation protein NifX  37.82 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1472  nitrogen fixation-related protein (NifX)  36.8 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437364  decreased coverage  0.0000979183 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7731  nitrogen fixation protein NifX  33.87 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3026  nitrogen fixation protein NifX  35.29 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1515  nitrogen fixation protein NifX  36.07 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3539  nitrogen fixation protein NifX  29.46 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.89885  decreased coverage  0.00377232 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1233  nitrogen fixation protein NifX  36.07 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000802968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3627  nitrogen fixation protein NifX  36.44 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3934  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.29 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0518816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.21 
 
 
243 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50910  Nitrogen fixation-related protein, gamma subunit  34.21 
 
 
243 aa  73.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0585445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5920  nitrogenase molybdenum-iron protein nifX  35.43 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4798  nitrogen fixation protein NifX  35.77 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0093  nitrogen fixation protein NifX  34.43 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.071454  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1058  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.54 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3991  nitrogen fixation protein NifX  29.37 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0536  putative nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  31.5 
 
 
158 aa  70.1  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2188  nitrogen fixation protein NifX  31.5 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.141271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2323  nitrogen fixation protein NifX  32.8 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0653956  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4140  nitrogen fixation protein NifX  34.62 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480569  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1790  nitrogen fixation protein NifX  35.16 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1818  nitrogen fixation protein NifX  35.16 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.92 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4052  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.06 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01420  Nitrogenase iron molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.83 
 
 
242 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6221  nitrogen fixation protein NifX  26.36 
 
 
165 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550036  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2114  nitrogen fixation protein NifX  34.65 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3207  nitrogen fixation protein NifX  36.59 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1565  nitrogen fixation protein NifX  28.57 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0270  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.33 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1251  nitrogen fixation protein NifX  32.79 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0265  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.5 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1348  nitrogen fixation protein NifX  32.23 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1198  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.06 
 
 
227 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.127129  hitchhiker  0.000500892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1506  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.77 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1455  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.48 
 
 
247 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0499  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.13 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01480  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifX  35.29 
 
 
158 aa  60.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0460  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.25 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.64 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1036  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.42 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1567  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.75 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02740  nitrogenase biosynthetic protein vnfX  29.46 
 
 
182 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0058  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.19 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0199747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02570  nitrogen fixation-related protein, vnfY  23.57 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0717484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.72 
 
 
468 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.63 
 
 
527 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1796  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.14 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>