68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0495 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0495  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0270  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.26 
 
 
247 aa  87  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50910  Nitrogen fixation-related protein, gamma subunit  35.77 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0585445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1054  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.6 
 
 
123 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.33 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3539  nitrogen fixation protein NifX  38.17 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.89885  decreased coverage  0.00377232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01420  Nitrogenase iron molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.34 
 
 
242 aa  82  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.25 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3991  nitrogen fixation protein NifX  35.2 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1455  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.7 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2284  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.3 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1198  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.4 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.127129  hitchhiker  0.000500892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6876  nitrogen fixation protein NifX  37.7 
 
 
148 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5920  nitrogenase molybdenum-iron protein nifX  35.77 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0634  nitrogen fixation protein NifX  33.33 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1565  nitrogen fixation protein NifX  34.56 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6221  nitrogen fixation protein NifX  32.09 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550036  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0671  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.54 
 
 
127 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4458  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.88 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2805  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifX  34.17 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0536  putative nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  34.88 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3627  nitrogen fixation protein NifX  32.52 
 
 
133 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5096  nitrogen fixation protein NifX  32.54 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2140  nitrogen fixation protein NifX  35.29 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0265  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.78 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0974  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.81 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649686  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2101  nitrogen fixation protein NifX  31.03 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2078  nitrogen fixation protein NifX  35.29 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2188  nitrogen fixation protein NifX  34.88 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.141271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0093  nitrogen fixation protein NifX  34.59 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.071454  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0478  nitrogen fixation protein NifX  34.38 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1233  nitrogen fixation protein NifX  33.33 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000802968 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1515  nitrogen fixation protein NifX  33.33 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19909  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7731  nitrogen fixation protein NifX  29.66 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1351  nitrogen fixation protein NifX  34.65 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  31.3 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2323  nitrogen fixation protein NifX  32.5 
 
 
136 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0653956  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3490  nitrogen fixation protein NifX  33.62 
 
 
132 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2114  nitrogen fixation protein NifX  29.23 
 
 
136 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1078  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.78 
 
 
132 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01480  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifX  32.14 
 
 
158 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1058  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.4 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1348  nitrogen fixation protein NifX  31.15 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3026  nitrogen fixation protein NifX  32.48 
 
 
137 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1251  nitrogen fixation protein NifX  33.58 
 
 
157 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1202  nitrogen fixation protein NifX  34.43 
 
 
128 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120985  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4140  nitrogen fixation protein NifX  30.4 
 
 
139 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480569  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1818  nitrogen fixation protein NifX  28.03 
 
 
135 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1472  nitrogen fixation-related protein (NifX)  31.36 
 
 
137 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437364  decreased coverage  0.0000979183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1790  nitrogen fixation protein NifX  28.03 
 
 
135 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3934  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.09 
 
 
137 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0518816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3207  nitrogen fixation protein NifX  34.71 
 
 
127 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4798  nitrogen fixation protein NifX  30.25 
 
 
138 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.41 
 
 
134 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1359  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.18 
 
 
120 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0058  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
106 aa  46.6  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0199747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.29 
 
 
423 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1506  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.41 
 
 
159 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  25 
 
 
146 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.63 
 
 
423 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.18 
 
 
423 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  25.95 
 
 
522 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2138  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30 
 
 
109 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2803  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  29.2 
 
 
109 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  26.67 
 
 
520 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4052  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  26.02 
 
 
133 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1036  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.66 
 
 
123 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  27.78 
 
 
520 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>