75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6876 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6876  nitrogen fixation protein NifX  100 
 
 		 148 aa  303  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  73.85 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0093  nitrogen fixation protein NifX  52.1 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.071454  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2323  nitrogen fixation protein NifX  52.94 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0653956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4458  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  51.69 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3627  nitrogen fixation protein NifX  54.62 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0634  nitrogen fixation protein NifX  48.31 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1472  nitrogen fixation-related protein (NifX)  49.21 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437364  decreased coverage  0.0000979183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5920  nitrogenase molybdenum-iron protein nifX  51.26 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0671  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  45.76 
 
 		 127 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2078  nitrogen fixation protein NifX  47.46 
 
 		 129 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1515  nitrogen fixation protein NifX  47.5 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1233  nitrogen fixation protein NifX  47.5 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2140  nitrogen fixation protein NifX  47.46 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3934  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  48.44 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0518816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2805  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifX  44.07 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  52.1 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1202  nitrogen fixation protein NifX  45.76 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120985  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1351  nitrogen fixation protein NifX  48 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1078  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  46.61 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0974  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  46.61 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649686  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  44.35 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5096  nitrogen fixation protein NifX  44.07 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1348  nitrogen fixation protein NifX  42.97 
 
 		 139 aa  107  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3490  nitrogen fixation protein NifX  44.92 
 
 		 132 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4798  nitrogen fixation protein NifX  41.27 
 
 		 138 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2114  nitrogen fixation protein NifX  40.32 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2284  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  42.74 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0478  nitrogen fixation protein NifX  45.67 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3026  nitrogen fixation protein NifX  42.74 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2101  nitrogen fixation protein NifX  40.68 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  47.01 
 
 		 243 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1790  nitrogen fixation protein NifX  40.32 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1818  nitrogen fixation protein NifX  40.32 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1565  nitrogen fixation protein NifX  42.31 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0460  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.46 
 
 		 168 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7731  nitrogen fixation protein NifX  43.7 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50910  Nitrogen fixation-related protein, gamma subunit  42.5 
 
 		 243 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0585445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3539  nitrogen fixation protein NifX  40.43 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.89885  decreased coverage  0.00377232 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0270  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.4 
 
 		 247 aa  94.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4140  nitrogen fixation protein NifX  35.94 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1198  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  41.8 
 
 		 227 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.127129  hitchhiker  0.000500892 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2188  nitrogen fixation protein NifX  41.09 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0536  putative nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  40.31 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01420  Nitrogenase iron molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.21 
 
 		 242 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3991  nitrogen fixation protein NifX  37.6 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0265  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.71 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1251  nitrogen fixation protein NifX  40.65 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6221  nitrogen fixation protein NifX  36.29 
 
 		 165 aa  86.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1455  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  40.17 
 
 		 247 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4052  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.92 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3207  nitrogen fixation protein NifX  44.44 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01480  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifX  35.83 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1054  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.82 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0495  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.7 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1058  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.93 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0499  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.04 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.03 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1506  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.65 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  38.16 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02570  nitrogen fixation-related protein, vnfY  25.71 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0717484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1036  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.58 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1567  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.98 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.46 
 
 		 520 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.61 
 
 		 527 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02740  nitrogenase biosynthetic protein vnfX  25.95 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.03 
 
 		 519 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  30.21 
 
 		 522 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.18 
 
 		 479 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1576  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.65 
 
 		 490 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  26.42 
 
 		 464 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.09 
 
 		 495 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1359  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.63 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  30.77 
 
 		 475 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  28.09 
 
 		 520 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>