76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1233 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1515  nitrogen fixation protein NifX  100 
 
 
138 aa  284  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1233  nitrogen fixation protein NifX  100 
 
 
138 aa  284  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000802968 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  73.76 
 
 
141 aa  217  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0093  nitrogen fixation protein NifX  75.19 
 
 
131 aa  213  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.071454  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5920  nitrogenase molybdenum-iron protein nifX  73.64 
 
 
131 aa  205  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1351  nitrogen fixation protein NifX  70.07 
 
 
143 aa  203  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2323  nitrogen fixation protein NifX  72.18 
 
 
136 aa  201  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0653956  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3627  nitrogen fixation protein NifX  68.94 
 
 
133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1472  nitrogen fixation-related protein (NifX)  68.42 
 
 
137 aa  194  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437364  decreased coverage  0.0000979183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1078  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  68.18 
 
 
132 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4458  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  69.4 
 
 
135 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5096  nitrogen fixation protein NifX  65.91 
 
 
132 aa  189  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0974  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  65.15 
 
 
155 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649686  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0478  nitrogen fixation protein NifX  65.67 
 
 
134 aa  181  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7731  nitrogen fixation protein NifX  60 
 
 
138 aa  176  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2114  nitrogen fixation protein NifX  55.88 
 
 
136 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4798  nitrogen fixation protein NifX  54.1 
 
 
138 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3934  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  53.33 
 
 
137 aa  146  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0518816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1348  nitrogen fixation protein NifX  52.59 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  49.25 
 
 
134 aa  144  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1818  nitrogen fixation protein NifX  50.74 
 
 
135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1790  nitrogen fixation protein NifX  50.74 
 
 
135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2284  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  46.15 
 
 
162 aa  140  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1565  nitrogen fixation protein NifX  40.29 
 
 
164 aa  133  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0671  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  49.61 
 
 
127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2805  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifX  47.24 
 
 
129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3539  nitrogen fixation protein NifX  40.14 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.89885  decreased coverage  0.00377232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3991  nitrogen fixation protein NifX  39.72 
 
 
163 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2188  nitrogen fixation protein NifX  43.07 
 
 
144 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.141271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1202  nitrogen fixation protein NifX  45.67 
 
 
128 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120985  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0536  putative nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  42.34 
 
 
158 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1251  nitrogen fixation protein NifX  40.94 
 
 
157 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4140  nitrogen fixation protein NifX  45.74 
 
 
139 aa  117  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480569  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2101  nitrogen fixation protein NifX  45.53 
 
 
119 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6221  nitrogen fixation protein NifX  37.86 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550036  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6876  nitrogen fixation protein NifX  47.5 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0634  nitrogen fixation protein NifX  42.62 
 
 
128 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2140  nitrogen fixation protein NifX  42.86 
 
 
129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2078  nitrogen fixation protein NifX  42.11 
 
 
129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4052  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  41.35 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  42.5 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3490  nitrogen fixation protein NifX  42.42 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01480  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifX  40.5 
 
 
158 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0460  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.25 
 
 
168 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1058  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.2 
 
 
128 aa  97.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3026  nitrogen fixation protein NifX  39.17 
 
 
137 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50910  Nitrogen fixation-related protein, gamma subunit  35.92 
 
 
243 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0585445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.43 
 
 
146 aa  90.1  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01420  Nitrogenase iron molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
242 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1506  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.29 
 
 
159 aa  84.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1455  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.59 
 
 
247 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0265  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.5 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.66 
 
 
243 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1198  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.25 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.127129  hitchhiker  0.000500892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3207  nitrogen fixation protein NifX  35.77 
 
 
127 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02570  nitrogen fixation-related protein, vnfY  26.53 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0717484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1054  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.07 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0499  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.65 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0270  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.93 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0495  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  32.67 
 
 
120 aa  57.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02740  nitrogenase biosynthetic protein vnfX  26.9 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1036  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.32 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.63 
 
 
519 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.71 
 
 
522 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.36 
 
 
527 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  33.33 
 
 
520 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.33 
 
 
520 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.09 
 
 
499 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  34.09 
 
 
522 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  27.55 
 
 
482 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0058  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.14 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0199747  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.57 
 
 
479 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.03 
 
 
531 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1538  hypothetical protein  27.59 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.94 
 
 
531 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>