More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0799 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  90.91 
 
 		 66 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  83.33 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  83.33 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  83.33 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  83.33 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  83.33 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  83.33 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  83.33 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  83.33 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  83.33 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  83.33 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  83.33 
 
 		 66 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  72.58 
 
 		 66 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  72.58 
 
 		 66 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  72.73 
 
 		 66 aa  92  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  68.18 
 
 		 66 aa  90.5  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  70.97 
 
 		 66 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 66 aa  89.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  65.15 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  61.29 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1279  50S ribosomal protein L35P  58.46 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.686056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1442  50S ribosomal protein L35  58.46 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000414498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  55.56 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  51.61 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  50.77 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1240  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000491229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  59.65 
 
 		 57 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  62  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl189  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  49.28 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1382  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>