More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2922 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  85.13 
 
 
436 aa  749    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  100 
 
 
437 aa  894    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  69.27 
 
 
430 aa  618  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  68.58 
 
 
430 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  68.35 
 
 
430 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  68.35 
 
 
430 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  68.12 
 
 
430 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  68.35 
 
 
430 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  68.35 
 
 
430 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  68.35 
 
 
430 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  67.89 
 
 
430 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  67.89 
 
 
430 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  68.12 
 
 
430 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  54.48 
 
 
435 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  54.48 
 
 
435 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  54.02 
 
 
435 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  40.97 
 
 
420 aa  335  9e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  41.76 
 
 
420 aa  334  1e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  39.12 
 
 
429 aa  318  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  39.86 
 
 
418 aa  300  3e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  35.92 
 
 
394 aa  244  3e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  33.97 
 
 
426 aa  229  7e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  34.78 
 
 
423 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  30.5 
 
 
487 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  29.58 
 
 
467 aa  220  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.98 
 
 
470 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  30.54 
 
 
464 aa  217  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  29.88 
 
 
476 aa  216  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  30.38 
 
 
479 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.88 
 
 
470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  29.79 
 
 
487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  30.09 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  30.43 
 
 
455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  32.41 
 
 
434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  30.82 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  29.31 
 
 
470 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  28.94 
 
 
476 aa  211  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.31 
 
 
490 aa  210  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  30.62 
 
 
479 aa  210  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.67 
 
 
483 aa  208  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.55 
 
 
470 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  27.67 
 
 
475 aa  207  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  29.82 
 
 
471 aa  207  3e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  29.05 
 
 
470 aa  206  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  28.71 
 
 
476 aa  206  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  30.14 
 
 
485 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  29.13 
 
 
470 aa  206  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  29.4 
 
 
488 aa  206  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  29.43 
 
 
476 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  29.72 
 
 
470 aa  205  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  28.61 
 
 
470 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  28.37 
 
 
476 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  29.18 
 
 
475 aa  203  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  32.02 
 
 
453 aa  203  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  29.43 
 
 
472 aa  203  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  29.08 
 
 
470 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  30.73 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  29.43 
 
 
481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  29.81 
 
 
477 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  27.66 
 
 
470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  31.28 
 
 
435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  28.13 
 
 
476 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  30.35 
 
 
499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  31.14 
 
 
469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.09 
 
 
482 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  28.23 
 
 
479 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  29.84 
 
 
552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  28.23 
 
 
480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  27.9 
 
 
481 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  28.23 
 
 
477 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  27.51 
 
 
470 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  29.84 
 
 
444 aa  196  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  27.88 
 
 
465 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 
467 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  27.88 
 
 
465 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  28.54 
 
 
485 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  27.36 
 
 
463 aa  195  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  27.99 
 
 
479 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  32.79 
 
 
405 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  28.23 
 
 
487 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  28.23 
 
 
487 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  28.23 
 
 
487 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  27.44 
 
 
472 aa  193  5e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  28.67 
 
 
471 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  28.31 
 
 
471 aa  192  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.31 
 
 
475 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.66 
 
 
482 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  27.96 
 
 
469 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  27.58 
 
 
465 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  28.44 
 
 
465 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  27.66 
 
 
481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  27.63 
 
 
469 aa  190  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  28.6 
 
 
472 aa  190  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  27.32 
 
 
470 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  26.3 
 
 
472 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  27.99 
 
 
485 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  27.62 
 
 
466 aa  187  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  27.45 
 
 
474 aa  187  4e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  28.24 
 
 
471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  34.73 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>