More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3309 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3309  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  547  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00793915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0021  ATPase associated with various cellular activities  93.36 
 
 
272 aa  518  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.954404  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0171  ATPase  88.24 
 
 
272 aa  488  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0037  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  86.4 
 
 
272 aa  481  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0036  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  86.4 
 
 
272 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0967142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2642  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  81.99 
 
 
272 aa  461  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1102  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.64 
 
 
281 aa  338  8e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.86062e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3634  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.02 
 
 
340 aa  309  3e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  31.1 
 
 
264 aa  68.9  8e-11  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29 
 
 
302 aa  64.3  2e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3075  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.81 
 
 
372 aa  63.5  3e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0611881  decreased coverage  3.72935e-08 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  30.72 
 
 
321 aa  63.5  4e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  31.25 
 
 
270 aa  63.2  4e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.2 
 
 
332 aa  63.5  4e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.72 
 
 
351 aa  63.2  4e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  27.32 
 
 
350 aa  63.2  5e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  30.77 
 
 
333 aa  62.8  6e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.92 
 
 
313 aa  61.6  1e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.78 
 
 
320 aa  61.2  2e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.33 
 
 
326 aa  60.8  2e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  28.57 
 
 
350 aa  60.8  2e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.49 
 
 
308 aa  60.1  4e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.39 
 
 
356 aa  59.7  5e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.72 
 
 
334 aa  59.7  5e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.08 
 
 
330 aa  59.7  6e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.08 
 
 
351 aa  59.3  7e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.43 
 
 
309 aa  59.3  7e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.77 
 
 
354 aa  59.3  7e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  27.13 
 
 
337 aa  59.3  7e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  27.42 
 
 
338 aa  58.9  9e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  26.77 
 
 
332 aa  58.9  9e-08  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  27.42 
 
 
338 aa  58.9  9e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  36.44 
 
 
260 aa  58.5  1e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.76 
 
 
341 aa  58.5  1e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  30.34 
 
 
316 aa  58.2  1e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  30.46 
 
 
315 aa  58.2  2e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.34 
 
 
295 aa  57.8  2e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.35 
 
 
342 aa  57.8  2e-07  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.36 
 
 
334 aa  57.4  3e-07  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.71 
 
 
266 aa  57  3e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  30.2 
 
 
314 aa  57.4  3e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.39 
 
 
344 aa  57.4  3e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  27.86 
 
 
327 aa  57  3e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  25.12 
 
 
312 aa  57  3e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.1 
 
 
308 aa  57  3e-07  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  26.63 
 
 
324 aa  56.6  4e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  28 
 
 
302 aa  56.6  4e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  32.73 
 
 
271 aa  57  4e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  27 
 
 
302 aa  57  4e-07  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.46 
 
 
332 aa  56.6  4e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  27.05 
 
 
319 aa  56.6  4e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  30.21 
 
 
335 aa  56.6  5e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  30.21 
 
 
335 aa  56.2  5e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3802  ATPase  25.6 
 
 
325 aa  56.2  5e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136563  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0535  ATPase  27.97 
 
 
313 aa  56.2  5e-07  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  7.89925e-05  normal  0.392501 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  26.11 
 
 
326 aa  56.6  5e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.09 
 
 
329 aa  56.6  5e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  27.45 
 
 
328 aa  56.6  5e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  28.34 
 
 
343 aa  56.2  5e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  33.9 
 
 
260 aa  56.2  6e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  32.28 
 
 
260 aa  56.2  6e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.62 
 
 
327 aa  55.8  6e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  29.28 
 
 
362 aa  55.8  7e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  29.03 
 
 
356 aa  55.8  7e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  27.71 
 
 
305 aa  55.8  7e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.34 
 
 
341 aa  55.8  7e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.34 
 
 
341 aa  55.8  7e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  23.28 
 
 
321 aa  55.5  8e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  25.76 
 
 
359 aa  55.5  8e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  25.23 
 
 
303 aa  55.5  8e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  31.21 
 
 
270 aa  55.8  8e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.43 
 
 
335 aa  55.5  9e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1685  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.74 
 
 
362 aa  55.5  1e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.942326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  26.39 
 
 
331 aa  55.1  1e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  26.6 
 
 
325 aa  55.1  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  27.81 
 
 
338 aa  55.5  1e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  26.34 
 
 
332 aa  55.5  1e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  26.34 
 
 
328 aa  55.1  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.95 
 
 
339 aa  55.5  1e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  28.45 
 
 
320 aa  55.5  1e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  32.28 
 
 
260 aa  55.5  1e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  26.19 
 
 
303 aa  54.3  2e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  25.98 
 
 
302 aa  54.3  2e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.27 
 
 
320 aa  54.3  2e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  32 
 
 
306 aa  54.7  2e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  28.33 
 
 
276 aa  53.9  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  24.43 
 
 
340 aa  54.3  2e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  27.51 
 
 
320 aa  54.3  2e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  26.05 
 
 
372 aa  54.7  2e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  30.77 
 
 
343 aa  54.3  2e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  25.19 
 
 
309 aa  54.7  2e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  4.6022e-07 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  27.89 
 
 
333 aa  54.3  2e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1205  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.78 
 
 
343 aa  53.5  3e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  27.54 
 
 
331 aa  53.9  3e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  26.53 
 
 
318 aa  53.9  3e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  27.57 
 
 
347 aa  53.9  3e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  25.22 
 
 
337 aa  53.5  3e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3573  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.02 
 
 
340 aa  53.9  3e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000738243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  26.84 
 
 
325 aa  53.9  3e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.67 
 
 
306 aa  53.5  3e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>