More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1816 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 453 aa  926    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  76.11 
 
 		 450 aa  706    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  82.48 
 
 		 450 aa  786    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  79.65 
 
 		 450 aa  738    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  75.88 
 
 		 450 aa  705    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  74.61 
 
 		 451 aa  704    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.44 
 
 		 452 aa  697    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  63 
 
 		 445 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.56 
 
 		 442 aa  569  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  62.11 
 
 		 443 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  62.33 
 
 		 445 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.43 
 
 		 444 aa  567  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.8 
 
 		 447 aa  567  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  59.96 
 
 		 440 aa  565  1e-160  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  61.21 
 
 		 441 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.98 
 
 		 448 aa  558  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.29 
 
 		 445 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  59.91 
 
 		 445 aa  557  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.64 
 
 		 463 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  60.09 
 
 		 440 aa  551  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.69 
 
 		 447 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  60 
 
 		 445 aa  549  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  59.91 
 
 		 450 aa  546  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.91 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.78 
 
 		 440 aa  546  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.78 
 
 		 440 aa  546  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  58.74 
 
 		 445 aa  541  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  58.7 
 
 		 453 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  61.8 
 
 		 438 aa  544  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  58.53 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  60 
 
 		 436 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.78 
 
 		 436 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.53 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  60 
 
 		 435 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  58.76 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  58.13 
 
 		 447 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  59.42 
 
 		 450 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  58.97 
 
 		 448 aa  535  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  57.79 
 
 		 470 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  56.4 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.46 
 
 		 447 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  56.49 
 
 		 476 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  57.54 
 
 		 457 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  56.4 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.66 
 
 		 442 aa  531  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  57.21 
 
 		 448 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.37 
 
 		 457 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  57.21 
 
 		 448 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.61 
 
 		 440 aa  529  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.85 
 
 		 445 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  57.91 
 
 		 449 aa  531  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  57.21 
 
 		 448 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.71 
 
 		 438 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.88 
 
 		 466 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  57.94 
 
 		 466 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  58.48 
 
 		 439 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  57.88 
 
 		 448 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.52 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.13 
 
 		 446 aa  525  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.52 
 
 		 454 aa  525  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.62 
 
 		 445 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.3 
 
 		 457 aa  521  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  57.3 
 
 		 454 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  57.39 
 
 		 454 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  57.14 
 
 		 470 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  58.39 
 
 		 454 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  57.67 
 
 		 466 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  57.43 
 
 		 440 aa  520  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.14 
 
 		 466 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.64 
 
 		 467 aa  518  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.23 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.57 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  57.72 
 
 		 440 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  55.63 
 
 		 435 aa  520  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  57.36 
 
 		 470 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  57.48 
 
 		 470 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  57.49 
 
 		 440 aa  519  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  57.78 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.36 
 
 		 470 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  57.02 
 
 		 437 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.02 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.48 
 
 		 470 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  56.79 
 
 		 437 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  57.4 
 
 		 444 aa  518  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.36 
 
 		 470 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.14 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  57.17 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.93 
 
 		 470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  56.98 
 
 		 436 aa  517  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  57.24 
 
 		 445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.17 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.15 
 
 		 445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.72 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  56.49 
 
 		 473 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  57.36 
 
 		 466 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.72 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.17 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.36 
 
 		 466 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.72 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.24 
 
 		 452 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.66393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>