79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0096 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0096  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.27062e-05 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0115  hypothetical protein  94.59 
 
 
259 aa  475  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0850  hypothetical protein  29.28 
 
 
211 aa  79.3  5e-14  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3048  hypothetical protein  38 
 
 
219 aa  72.4  8e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  27.07 
 
 
232 aa  69.3  5e-11  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  2.66535e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1229  hypothetical protein  38.38 
 
 
219 aa  69.3  6e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  33.19 
 
 
232 aa  68.9  7e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  32.74 
 
 
235 aa  68.2  1e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  35.29 
 
 
220 aa  67  3e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  27.64 
 
 
226 aa  66.2  5e-10  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  28.27 
 
 
221 aa  65.5  8e-10  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  28.73 
 
 
621 aa  63.2  4e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  27.75 
 
 
225 aa  63.2  4e-09  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  35.96 
 
 
225 aa  60.5  2e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  60.1  4e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  1.09984e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1245  hypothetical protein  30.34 
 
 
228 aa  59.7  5e-08  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  30.56 
 
 
234 aa  57.4  2e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  32.77 
 
 
272 aa  57  3e-07  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  31.66 
 
 
230 aa  57  3e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  31.66 
 
 
230 aa  56.6  3e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  3.81426e-09 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  31.66 
 
 
230 aa  56.6  3e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  32.4 
 
 
274 aa  56.2  4e-07  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1574  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  55.8  6e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  29.41 
 
 
249 aa  55.8  7e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  29.29 
 
 
228 aa  55.5  8e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  34.18 
 
 
226 aa  55.5  8e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1485  hypothetical protein  22.53 
 
 
219 aa  54.7  1e-06  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  32.2 
 
 
273 aa  55.1  1e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0373  hypothetical protein  28.49 
 
 
220 aa  55.5  1e-06  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  31.34 
 
 
221 aa  53.9  2e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  29.25 
 
 
235 aa  53.9  2e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.92671e-06  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  23.05 
 
 
499 aa  54.7  2e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1666  hypothetical protein  22.53 
 
 
219 aa  54.7  2e-06  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.809334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1224  hypothetical protein  32.38 
 
 
220 aa  53.5  3e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.042848  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  32.39 
 
 
219 aa  53.5  3e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  31.31 
 
 
230 aa  52.4  7e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  32.58 
 
 
344 aa  52  9e-06  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  4.18366e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  28.5 
 
 
230 aa  51.6  1e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  30.69 
 
 
224 aa  51.2  1e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  28.91 
 
 
249 aa  52  1e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  30.65 
 
 
230 aa  51.6  1e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  30.65 
 
 
230 aa  51.6  1e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  30.65 
 
 
230 aa  51.2  2e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  30.65 
 
 
230 aa  51.2  2e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  31.52 
 
 
230 aa  50.8  2e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  32.4 
 
 
225 aa  51.2  2e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  31.89 
 
 
225 aa  50.4  3e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  28.43 
 
 
230 aa  50.4  3e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  35.68 
 
 
223 aa  49.7  5e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  27.47 
 
 
279 aa  49.7  5e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1841  hypothetical protein  24.1 
 
 
219 aa  49.7  5e-05  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  28.64 
 
 
224 aa  49.7  5e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  30.41 
 
 
229 aa  49.3  6e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  28.3 
 
 
239 aa  49.3  6e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1831  hypothetical protein  29.65 
 
 
233 aa  48.9  7e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0686  hypothetical protein  28.26 
 
 
238 aa  48.9  8e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  33.53 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  25.79 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1364  hypothetical protein  29.17 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1338  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0899  hypothetical protein  30.56 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  29.91 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  1.60717e-07 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  27.42 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1236  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1176  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.526094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  27.59 
 
 
220 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  26.85 
 
 
231 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  31.58 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2489  integral membrane protein  28.81 
 
 
228 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0864666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5319  hypothetical protein  28.8 
 
 
253 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  29.69 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1959  hypothetical protein  24.79 
 
 
423 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178526  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0467  hypothetical protein  29.27 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  25.42 
 
 
471 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.26874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.28 
 
 
608 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  31.87 
 
 
236 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0800  hypothetical protein  27.56 
 
 
263 aa  42.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1143  hypothetical protein  25.14 
 
 
226 aa  42.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00632883  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0400  hypothetical protein  27.57 
 
 
297 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>