31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5559 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  58.91 
 
 		 755 aa  834    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  72.42 
 
 		 751 aa  1105    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  59.59 
 
 		 769 aa  887    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  61.25 
 
 		 751 aa  916    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  57.12 
 
 		 756 aa  843    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  55.75 
 
 		 745 aa  830    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  100 
 
 		 750 aa  1535    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  27.44 
 
 		 324 aa  93.6  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  25 
 
 		 325 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  24.19 
 
 		 338 aa  91.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.6 
 
 		 327 aa  88.2  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  25.16 
 
 		 330 aa  87.8  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 326 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  27.54 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.45 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  28.73 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  22.46 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.78 
 
 		 344 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  26.94 
 
 		 347 aa  72  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  22.87 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  22.95 
 
 		 314 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6100  methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 364 aa  62  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  25.22 
 
 		 335 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5945  methyltransferase type 12  29.7 
 
 		 677 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  22.92 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6509  hypothetical protein  29.43 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1320  hypothetical protein  29.43 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.472657  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  22.95 
 
 		 324 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  21.82 
 
 		 323 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1991  terpene synthase metal-binding protein  23.14 
 
 		 373 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  24.37 
 
 		 393 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>