More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1571 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1571  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
348 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.869023  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  48.72 
 
 
324 aa  279  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  56.01 
 
 
316 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  49.3 
 
 
335 aa  275  8e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  53.41 
 
 
311 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3589  heat shock protein DnaJ domain protein  49.86 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0561803  normal  0.0551979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.09 
 
 
324 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.71 
 
 
315 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  40.11 
 
 
315 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.43 
 
 
341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.43 
 
 
313 aa  216  4e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00580  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  41.49 
 
 
297 aa  216  7e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  40.28 
 
 
326 aa  212  9e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  38.84 
 
 
313 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  40.34 
 
 
315 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  43.82 
 
 
304 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  42.36 
 
 
313 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  37.53 
 
 
327 aa  206  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  38.38 
 
 
324 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.68 
 
 
326 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  40.45 
 
 
315 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  35.92 
 
 
306 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  35.92 
 
 
306 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  35.92 
 
 
306 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  35.92 
 
 
306 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  35.92 
 
 
306 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.98 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  35.45 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  36.96 
 
 
326 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  40.35 
 
 
314 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  35.45 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  35.45 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  35.45 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  35.45 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  35.45 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  35.45 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  36.83 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  35.88 
 
 
296 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  40.35 
 
 
294 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.31 
 
 
323 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  35.16 
 
 
306 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  38.59 
 
 
314 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  35.16 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  35.14 
 
 
301 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  35.59 
 
 
296 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  39.6 
 
 
313 aa  192  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  41.4 
 
 
310 aa  192  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  41.4 
 
 
310 aa  192  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  36.03 
 
 
320 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  37.46 
 
 
314 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  39.83 
 
 
331 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.58 
 
 
313 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  38.83 
 
 
320 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  38.53 
 
 
313 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  39.24 
 
 
308 aa  185  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  38.62 
 
 
321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.8 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  37.72 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.06 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.91 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.55 
 
 
315 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  39.39 
 
 
331 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.11 
 
 
331 aa  182  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  36.34 
 
 
330 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  32.85 
 
 
307 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.98 
 
 
334 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.7 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  40.56 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  35.38 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.3 
 
 
351 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.05 
 
 
324 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  32.62 
 
 
299 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.67 
 
 
347 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  34.45 
 
 
335 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  33.84 
 
 
291 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.63 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.38 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.5 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  38.15 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.67 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  35.67 
 
 
297 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  42.69 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  35.29 
 
 
319 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  37.61 
 
 
302 aa  172  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  42.4 
 
 
318 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  31.02 
 
 
330 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  32.93 
 
 
293 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  35.55 
 
 
309 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  35.6 
 
 
333 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  42.4 
 
 
318 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  32.88 
 
 
339 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  35 
 
 
294 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  31.74 
 
 
314 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.91 
 
 
291 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.28 
 
 
319 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  39.52 
 
 
318 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1311  DnaJ-class molecular chaperone  34.58 
 
 
341 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.43 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  34.41 
 
 
294 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  35.29 
 
 
311 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>