76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4343 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  59.65 
 
 		 291 aa  326  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  59.33 
 
 		 290 aa  316  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  52.65 
 
 		 287 aa  255  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  51.41 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  53.41 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  53.72 
 
 		 285 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  47.7 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  47.7 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  47.7 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  51.14 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  52.82 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  52.82 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  52.82 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  47.2 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  49.81 
 
 		 294 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  47.46 
 
 		 280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  48.24 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  45.45 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  46.13 
 
 		 286 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  47.74 
 
 		 279 aa  225  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  46.86 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  45.76 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  43.84 
 
 		 285 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  43.2 
 
 		 334 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  45.8 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  44.86 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  45.55 
 
 		 281 aa  208  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  47.26 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  47.26 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  43.38 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  43.15 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  42.51 
 
 		 301 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  40 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  40 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  40 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  40.88 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  40.49 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  38.87 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  37.75 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.47 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  28.31 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  27.7 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  26.92 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  27.84 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  25.83 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  24.37 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  23.29 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  24.82 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  25.35 
 
 		 335 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  28.76 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  24.37 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 344 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  24.37 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  24.37 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  24.37 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  33.08 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.12 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  25.96 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.23 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  27.56 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  32.29 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  31.96 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.34 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  27.13 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  24.18 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  26.24 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  26.24 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  26.24 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.15 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  25 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  24.91 
 
 		 314 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  26.21 
 
 		 345 aa  42.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>