66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4259 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4259  DNA integrity scanning protein DisA  100 
 
 		 359 aa  701    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0358  DNA integrity scanning protein DisA  96.66 
 
 		 359 aa  679    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4467  protein of unknown function DUF147  78.47 
 
 		 361 aa  528  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4700  DNA integrity scanning protein DisA  73.82 
 
 		 391 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4270  DNA integrity scanning protein DisA  73.82 
 
 		 391 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0977721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0156  hypothetical protein  71.63 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0644  DNA integrity scanning, DisA, linker region  71.87 
 
 		 361 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0469  DNA integrity scanning protein DisA  72.02 
 
 		 360 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0469661  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0229  DNA integrity scanning protein DisA  74.08 
 
 		 368 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.743855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0602  DNA integrity scanning protein DisA  71.95 
 
 		 359 aa  484  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.594606  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8362  DNA integrity scanning protein DisA  71.71 
 
 		 362 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9144  DNA integrity scanning protein DisA  74.86 
 
 		 361 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06870  predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain)  69.25 
 
 		 361 aa  479  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0565  DNA integrity scanning, DisA, linker region  71.63 
 
 		 358 aa  475  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336088  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0492  DNA integrity scanning protein DisA  67.42 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0442874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0396  protein of unknown function DUF147  68.56 
 
 		 361 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3280  DNA integrity scanning protein DisA  68.33 
 
 		 359 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360002  hitchhiker  0.00479784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0863  DNA integrity scanning protein DisA  64.37 
 
 		 362 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24570  DNA integrity scanning protein DisA  62.22 
 
 		 361 aa  421  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0190  DNA integrity scanning protein DisA  59.67 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0343  DNA integrity scanning protein DisA  59.61 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5129  DNA integrity scanning protein DisA  61.82 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5343  DNA integrity scanning protein DisA  61.54 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4829  DNA integrity scanning protein DisA  61.82 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4743  DNA integrity scanning protein DisA  61.82 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557904  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13619  DNA integrity scanning protein DisA  62.25 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391574  normal  0.0991007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1441  DNA integrity scanning protein DisA  60.4 
 
 		 373 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.310912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0966  protein of unknown function DUF147  62.04 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0598  protein of unknown function DUF147  57.79 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00890  DNA integrity scanning protein DisA  48.01 
 
 		 359 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000509025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0397  DNA integrity scanning protein DisA  47.44 
 
 		 352 aa  332  7.000000000000001e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.265601  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0183  DNA integrity scanning protein DisA  46.65 
 
 		 358 aa  326  5e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00396468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0183  DNA integrity scanning protein DisA  47.03 
 
 		 361 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.876068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0159  DNA integrity scanning protein DisA  45.43 
 
 		 363 aa  318  7e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000331383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0337  DNA integrity scanning protein DisA  44.73 
 
 		 361 aa  317  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.828831  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2429  DNA integrity scanning protein DisA  45.87 
 
 		 354 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0257  DNA integrity scanning protein DisA  46.02 
 
 		 359 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169312  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1686  DNA integrity scanning, DisA, linker region  46.11 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1785  DNA integrity scanning protein DisA  45.14 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2738  DNA integrity scanning protein DisA  44.51 
 
 		 359 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.403042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0078  DNA integrity scanning protein DisA  42.03 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0104  DNA integrity scanning protein DisA  41.74 
 
 		 357 aa  286  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0360377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0083  DNA integrity scanning protein DisA  41.45 
 
 		 357 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0080  DNA integrity scanning protein DisA  41.45 
 
 		 357 aa  285  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0079  DNA integrity scanning protein DisA  41.45 
 
 		 357 aa  285  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0082  DNA integrity scanning protein DisA  41.45 
 
 		 357 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0093  DNA integrity scanning protein DisA  41.45 
 
 		 357 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0083  DNA integrity scanning protein DisA  41.45 
 
 		 357 aa  285  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0113  DNA integrity scanning protein DisA  41.16 
 
 		 357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0078  DNA integrity scanning protein DisA  41.74 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5222  DNA integrity scanning protein DisA  41.45 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0527052  unclonable  8.74316e-26 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2365  DNA integrity scanning protein DisA  42.65 
 
 		 356 aa  279  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1478  DNA integrity scanning protein DisA  41.54 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.108423  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1902  DNA integrity scanning protein DisA  43.86 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2177  DNA integrity scanning protein DisA  42.61 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441332  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2457  protein of unknown function DUF147  36 
 
 		 351 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0748  DNA integrity scanning protein DisA  42.01 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1857  DNA integrity scanning protein DisA  37.1 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.340997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0724  DNA integrity scanning protein DisA  41.42 
 
 		 357 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0775  protein of unknown function DUF147  32.44 
 
 		 349 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0087  DNA integrity scanning protein DisA  33.14 
 
 		 354 aa  200  3.9999999999999996e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1185  DNA integrity scanning protein DisA  34.2 
 
 		 359 aa  192  6e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0217461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0365  DNA integrity scanning protein DisA  30.12 
 
 		 369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.864277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4183  Tetratricopeptide TPR_4  37.59 
 
 		 549 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  36.62 
 
 		 833 aa  43.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  42.55 
 
 		 212 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>