299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3817 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  100 
 
 		 447 aa  857    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  83.12 
 
 		 474 aa  743    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  66.91 
 
 		 412 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  66.82 
 
 		 429 aa  500  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1190  MgtE intracellular region  64.22 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.067335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  59.77 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0802  MgtE intracellular region  60.58 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0717  MgtE intracellular region  61.52 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  57.32 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  59.42 
 
 		 426 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  59.65 
 
 		 402 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2208  MgtE intracellular region  57.35 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4488  MgtE intracellular region  57.11 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.837041  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  58.84 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  54.81 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  54.81 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  55.85 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1681  MgtE intracellular region  55.63 
 
 		 431 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106965  normal  0.399701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  59.04 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  54.46 
 
 		 417 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1864  MgtE intracellular region  52.62 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  56.13 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0317832 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  57.24 
 
 		 430 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27830  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  54.13 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.885994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  51.22 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11257  hypothetical protein  52.43 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1195  MgtE intracellular region  51.33 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2790  MgtE intracellular region  49.76 
 
 		 427 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045049  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15330  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  49.41 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346083  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2913  MgtE intracellular region  55.53 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.553029  normal  0.0535058 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19370  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  50 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503098  normal  0.0197915 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11290  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  49.31 
 
 		 453 aa  346  5e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371515  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  31.55 
 
 		 421 aa  187  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  30.71 
 
 		 430 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  32.3 
 
 		 625 aa  160  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  27.57 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  28.57 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0475  MgtE intracellular region  33.17 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45499  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0595  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 		 418 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297001  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  27.55 
 
 		 420 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7400  hypothetical protein  29.82 
 
 		 430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.090921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  24.76 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  25 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  35.5 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  36.33 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  34.33 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  24.76 
 
 		 423 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  24.76 
 
 		 423 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  36.22 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  36.75 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  34.65 
 
 		 542 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  31.65 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  29.54 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  35.09 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  32.57 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  24.41 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  31.72 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  33.59 
 
 		 465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  34.68 
 
 		 460 aa  110  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  33.75 
 
 		 466 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  35.22 
 
 		 462 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  35.22 
 
 		 462 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  34.38 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  34.51 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  32.26 
 
 		 450 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  34.09 
 
 		 449 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  26.36 
 
 		 443 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  33.19 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  31.91 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  33.19 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  29.61 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  33.91 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  32.05 
 
 		 444 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  30.13 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2656  Mg/Co/Ni transporter MgtE  35.65 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  33.33 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  30.09 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  30.67 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  27.08 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  34.56 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  29.23 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  29.08 
 
 		 479 aa  98.2  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  30.26 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  30.26 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  32.75 
 
 		 471 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  30.26 
 
 		 454 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  34.82 
 
 		 465 aa  97.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  27.73 
 
 		 456 aa  97.1  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  28.69 
 
 		 454 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  29.82 
 
 		 454 aa  97.1  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  27.84 
 
 		 446 aa  97.1  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  28.35 
 
 		 454 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  34.07 
 
 		 486 aa  96.7  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  32.02 
 
 		 486 aa  97.1  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  30.48 
 
 		 468 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  30.8 
 
 		 454 aa  96.7  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  28.35 
 
 		 454 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  29.26 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  28.35 
 
 		 454 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  30.67 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>