More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2807 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02169  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), small subunit  85.1 
 
 
396 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1416  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  85.35 
 
 
396 aa  720    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403336  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  87.12 
 
 
396 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444575  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3380  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  85.35 
 
 
396 aa  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2541  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  84.85 
 
 
396 aa  719    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0229  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  72.41 
 
 
415 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0567  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  72.41 
 
 
431 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  77.97 
 
 
399 aa  662    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0158986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2807  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  100 
 
 
396 aa  827    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.632443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  85.1 
 
 
396 aa  717    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1408  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  85.35 
 
 
396 aa  720    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0250  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  75.06 
 
 
400 aa  637    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149174  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  76.34 
 
 
400 aa  646    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2630  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  87.12 
 
 
396 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.484622 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4146  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  76.57 
 
 
403 aa  646    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2384  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  85.1 
 
 
396 aa  719    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3955  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  76.32 
 
 
403 aa  645    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2471  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  86.87 
 
 
396 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.496093  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2625  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  85.1 
 
 
396 aa  719    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3989  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  72.41 
 
 
415 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.379671  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2422  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  87.37 
 
 
396 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02128  hypothetical protein  85.1 
 
 
396 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2526  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  87.12 
 
 
396 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  62.5 
 
 
423 aa  528  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0688  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  61.36 
 
 
413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  60.1 
 
 
424 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1019  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  48.99 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1125  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  37.75 
 
 
499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0069  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  37.94 
 
 
409 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2842  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  37.08 
 
 
396 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000733482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3301  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  36.68 
 
 
415 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4113  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  35.48 
 
 
416 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  0.0186832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4561  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.95 
 
 
453 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2960  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  33.17 
 
 
448 aa  249  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1519  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  35.77 
 
 
409 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.717289  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0931  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  32.26 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2518  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  31.74 
 
 
461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  32.3 
 
 
459 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0766  hypothetical protein  28.54 
 
 
455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0817  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.54 
 
 
455 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0813  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.78 
 
 
455 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0812  hypothetical protein  28.54 
 
 
454 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0290283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.44 
 
 
978 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.96 
 
 
429 aa  170  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.17 
 
 
976 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0836  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.19 
 
 
447 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000205692  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  29.38 
 
 
1032 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.2 
 
 
962 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1846  putative ferredoxin  28.95 
 
 
443 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000698817  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.76 
 
 
1035 aa  159  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  29.05 
 
 
1055 aa  159  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0866  FAD linked oxidase domain protein  29.56 
 
 
1020 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1107  putative ferredoxin  31.41 
 
 
442 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0158261  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.36 
 
 
1015 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  28.73 
 
 
1024 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4115  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.71 
 
 
445 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  29.8 
 
 
952 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  27.48 
 
 
967 aa  146  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.65 
 
 
984 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0419  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.69 
 
 
450 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  27.62 
 
 
1070 aa  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0539  hypothetical protein  29.18 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835661  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4547  Fe-S oxidoreductase-like  27.1 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.975746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3816  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.1 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3708  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.1 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3719  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.32 
 
 
445 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.320551 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.25 
 
 
1023 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.45 
 
 
1007 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  28.06 
 
 
730 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2280  Fe-S oxidoreductase-like  26.43 
 
 
445 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4923  Fe-S oxidoreductase-like protein  26.71 
 
 
445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0114822 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5542  Fe-S oxidoreductase-like protein  27.08 
 
 
445 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  26.65 
 
 
1014 aa  135  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  26.15 
 
 
996 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.68 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0269  hypothetical protein  29.88 
 
 
445 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1646  hypothetical protein  29.88 
 
 
445 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0301  hypothetical protein  29.88 
 
 
445 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2628  hypothetical protein  30.21 
 
 
445 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0362  protein of unknown function DUF162  26.48 
 
 
738 aa  133  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2490  hypothetical protein  30.21 
 
 
445 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  26.37 
 
 
973 aa  133  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0048  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), K-small subunit  25.57 
 
 
468 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.923386  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1449  hypothetical protein  29.57 
 
 
445 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  28.89 
 
 
717 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0295  hypothetical protein  27.71 
 
 
399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.630234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.8 
 
 
968 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0922  putative ferredoxin  29.88 
 
 
445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2097  putative ferredoxin  28.03 
 
 
449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.15 
 
 
1025 aa  129  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3264  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.75 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.726047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0525  hypothetical protein  25.3 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000837043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  29.03 
 
 
711 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  27.62 
 
 
423 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  29.08 
 
 
708 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 
423 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2667  protein of unknown function DUF162  25.82 
 
 
727 aa  126  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.32 
 
 
395 aa  125  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  28.41 
 
 
1024 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3639  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.65 
 
 
456 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>