More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0836 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0836  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 
447 aa  932    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000205692  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0419  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  79.16 
 
 
450 aa  747    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1107  putative ferredoxin  60.45 
 
 
442 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0158261  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1846  putative ferredoxin  58.24 
 
 
443 aa  548  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000698817  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3715  putative ferredoxin  57.24 
 
 
449 aa  541  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0539693  normal  0.153427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2097  putative ferredoxin  57.4 
 
 
449 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2673  putative ferredoxin  55.41 
 
 
454 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4115  Fe-S oxidoreductase-like protein  54.05 
 
 
445 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0539  hypothetical protein  54.71 
 
 
445 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.835661  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2490  hypothetical protein  55.28 
 
 
445 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2374  putative ferredoxin  54.67 
 
 
466 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.790506  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2628  hypothetical protein  55.18 
 
 
445 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0269  hypothetical protein  55.28 
 
 
445 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0922  putative ferredoxin  54.61 
 
 
445 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0301  hypothetical protein  55.28 
 
 
445 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5542  Fe-S oxidoreductase-like protein  53.03 
 
 
445 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3719  Fe-S oxidoreductase-like protein  52.58 
 
 
445 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.320551 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1449  hypothetical protein  55.06 
 
 
445 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214428  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1646  hypothetical protein  55.28 
 
 
445 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2280  Fe-S oxidoreductase-like  52.13 
 
 
445 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3708  Fe-S oxidoreductase-like protein  53.03 
 
 
445 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4547  Fe-S oxidoreductase-like  53.03 
 
 
445 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.975746  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3816  Fe-S oxidoreductase-like protein  53.03 
 
 
445 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4923  Fe-S oxidoreductase-like protein  52.36 
 
 
445 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0114822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3639  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  42.86 
 
 
456 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820206 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0898  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.01 
 
 
429 aa  298  2e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0817  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.88 
 
 
455 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0766  hypothetical protein  33.41 
 
 
455 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0813  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.88 
 
 
455 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0812  hypothetical protein  33.88 
 
 
454 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0290283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.16 
 
 
395 aa  207  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0295  hypothetical protein  29.77 
 
 
399 aa  194  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.630234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3301  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  30.55 
 
 
415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4113  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  30.7 
 
 
416 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  0.0186832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0069  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  30.31 
 
 
409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2807  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  30.19 
 
 
396 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.632443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  30.16 
 
 
399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0158986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2422  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.74 
 
 
396 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2526  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.5 
 
 
396 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.5 
 
 
396 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444575  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2471  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.5 
 
 
396 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.496093  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2630  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.5 
 
 
396 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.484622 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0250  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  30.79 
 
 
400 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4146  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  31.25 
 
 
403 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02169  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), small subunit  27.67 
 
 
396 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2625  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.67 
 
 
396 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.67 
 
 
396 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2384  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.67 
 
 
396 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02128  hypothetical protein  27.67 
 
 
396 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3955  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  31.7 
 
 
403 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2541  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.67 
 
 
396 aa  150  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1125  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  33.44 
 
 
499 aa  150  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1416  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  27.67 
 
 
396 aa  150  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3380  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.67 
 
 
396 aa  150  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1408  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.67 
 
 
396 aa  150  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4561  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.48 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2842  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.15 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000733482  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.52 
 
 
459 aa  146  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.789463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0567  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.37 
 
 
431 aa  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3989  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.91 
 
 
415 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.379671  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0229  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.43 
 
 
415 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0931  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  28.26 
 
 
478 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.62 
 
 
400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.55 
 
 
424 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2960  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, C subunit  30.88 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0688  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  31.03 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0514  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.2 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1519  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.75 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.717289  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2518  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  28.01 
 
 
461 aa  128  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0048  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), K-small subunit  24.57 
 
 
468 aa  127  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.923386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1606  putative Fe-S oxidoreductase  24.46 
 
 
470 aa  119  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.822852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1019  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.88 
 
 
400 aa  111  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  24.26 
 
 
996 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  22.06 
 
 
973 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.78 
 
 
978 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0866  FAD linked oxidase domain protein  23.12 
 
 
1020 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.42 
 
 
976 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  23.87 
 
 
1032 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  25.15 
 
 
711 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  27.7 
 
 
708 aa  94  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  26.69 
 
 
1024 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2541  hypothetical protein  24.14 
 
 
446 aa  94  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000879151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4384  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.55 
 
 
414 aa  93.6  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  23.75 
 
 
730 aa  93.2  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.78 
 
 
411 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  28.34 
 
 
714 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.74 
 
 
722 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  22.25 
 
 
1055 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  25.82 
 
 
421 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.72 
 
 
414 aa  90.5  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  30.61 
 
 
712 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.76 
 
 
991 aa  87  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.9 
 
 
1034 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.1 
 
 
962 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3264  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.19 
 
 
428 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.726047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  21.62 
 
 
989 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24 
 
 
961 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.14 
 
 
1009 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  27.94 
 
 
716 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2667  protein of unknown function DUF162  25.13 
 
 
727 aa  84  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>