More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2504 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
340 aa  698  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  698  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.44785e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  698  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.09839e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  698  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  6.70285e-05  unclonable  1.17832e-08 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  99.71 
 
 
340 aa  695  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.21549e-05  hitchhiker  4.24543e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  698  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.58206e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  99.12 
 
 
340 aa  692  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  1.28745e-12 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  698  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  99.71 
 
 
340 aa  696  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.02204e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  85 
 
 
340 aa  613  1e-174  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  86.47 
 
 
340 aa  604  1e-172  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.0184e-13 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  86.47 
 
 
340 aa  605  1e-172  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  1.01215e-15 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  86.76 
 
 
340 aa  607  1e-172  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  86.47 
 
 
340 aa  604  1e-172  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  86.47 
 
 
340 aa  604  1e-172  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  3.63112e-14 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  63.17 
 
 
363 aa  428  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.56203e-05  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  63.47 
 
 
341 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  61.65 
 
 
341 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.14961e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  61.13 
 
 
341 aa  411  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  9.53369e-09  decreased coverage  7.38863e-07 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  60 
 
 
339 aa  404  1e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  59.12 
 
 
339 aa  398  1e-110  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  57.1 
 
 
343 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  57.89 
 
 
343 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.11162e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  44.05 
 
 
338 aa  298  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  45.56 
 
 
338 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  44.25 
 
 
346 aa  294  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  43.93 
 
 
336 aa  284  1e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  43.71 
 
 
338 aa  275  6e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  42.22 
 
 
336 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  42.22 
 
 
336 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  39.16 
 
 
356 aa  252  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  44.08 
 
 
337 aa  246  5e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  41.92 
 
 
336 aa  244  2e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  38.67 
 
 
335 aa  244  2e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  41.96 
 
 
345 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  41.32 
 
 
345 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  41.32 
 
 
345 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  41.67 
 
 
345 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  38.18 
 
 
349 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  41.62 
 
 
336 aa  239  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  41.23 
 
 
324 aa  239  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  38.18 
 
 
349 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  38.3 
 
 
332 aa  236  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  40.25 
 
 
345 aa  235  8e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  39.82 
 
 
355 aa  234  2e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  40.12 
 
 
335 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  39.81 
 
 
312 aa  232  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  40.85 
 
 
339 aa  232  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  39.37 
 
 
387 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  39.63 
 
 
337 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  39.94 
 
 
351 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0154  aminodeoxychorismate lyase  44.57 
 
 
427 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  38.69 
 
 
335 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  44.89 
 
 
427 aa  227  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  38.73 
 
 
400 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  39.33 
 
 
342 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  39.58 
 
 
331 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  38.73 
 
 
406 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  37.01 
 
 
379 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  38.81 
 
 
336 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1922  aminodeoxychorismate lyase  40.77 
 
 
335 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  38.41 
 
 
421 aa  223  5e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  3.31509e-07 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  38.82 
 
 
334 aa  223  5e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  40.48 
 
 
333 aa  221  1e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2052  aminodeoxychorismate lyase  39.26 
 
 
492 aa  219  4e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  39.51 
 
 
331 aa  219  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  36.09 
 
 
343 aa  219  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  39.39 
 
 
332 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  42.75 
 
 
393 aa  219  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  8.81139e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  37.9 
 
 
403 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  39.3 
 
 
328 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  36.47 
 
 
371 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  38.64 
 
 
358 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  38.67 
 
 
316 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  40.14 
 
 
332 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  36.42 
 
 
343 aa  215  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  42.7 
 
 
363 aa  215  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  40.13 
 
 
345 aa  214  1e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  35.21 
 
 
370 aa  213  4e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  39.81 
 
 
345 aa  213  5e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  43.02 
 
 
328 aa  212  6e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  40.96 
 
 
337 aa  212  6e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  38.98 
 
 
339 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  36.69 
 
 
341 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 
323 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  37.7 
 
 
339 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  39.46 
 
 
315 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  37.7 
 
 
339 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  37.7 
 
 
339 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  40.32 
 
 
357 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  38.34 
 
 
339 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  40.07 
 
 
332 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  37.82 
 
 
438 aa  208  9e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  38.34 
 
 
339 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 
393 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1981  aminodeoxychorismate lyase  39.22 
 
 
335 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0643733  hitchhiker  0.0054614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  40.14 
 
 
331 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  38.02 
 
 
339 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0876  aminodeoxychorismate lyase  44.89 
 
 
353 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  37.5 
 
 
412 aa  205  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>