161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01163 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  65.02 
 
 
560 aa  694  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  100 
 
 
510 aa  1070  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.58794e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  100 
 
 
510 aa  1070  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.95748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2448  SpoVR family protein  71.8 
 
 
506 aa  793  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0619548  normal  0.114389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  88.15 
 
 
511 aa  940  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  5.64649e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1960  SpoVR family protein  73.49 
 
 
504 aa  791  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  73.43 
 
 
508 aa  804  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2329  SpoVR family protein  62.18 
 
 
542 aa  664  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851956  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1623  SpoVR family protein  65.45 
 
 
557 aa  701  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296087 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  85.54 
 
 
511 aa  922  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0426  SpoVR family protein  67.95 
 
 
522 aa  708  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375889  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  85.74 
 
 
511 aa  924  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  100 
 
 
510 aa  1070  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  76.41 
 
 
519 aa  820  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  85.74 
 
 
511 aa  924  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  73.02 
 
 
508 aa  800  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.04423e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  65.02 
 
 
560 aa  694  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  65.02 
 
 
560 aa  694  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  65.02 
 
 
560 aa  694  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1831  SpoVR family protein  71.77 
 
 
510 aa  790  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  96.47 
 
 
510 aa  1044  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1684  SpoVR family protein  72.6 
 
 
505 aa  801  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.08668e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  67.99 
 
 
521 aa  747  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  74.85 
 
 
516 aa  823  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0429  SpoVR family protein  67.95 
 
 
522 aa  708  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00886666  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0729  SpoVR family protein  68.97 
 
 
517 aa  721  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  73.23 
 
 
508 aa  803  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.99877e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  99.61 
 
 
510 aa  1068  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4807  SpoVR family protein  67.55 
 
 
522 aa  703  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.091895  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  74.8 
 
 
505 aa  821  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  99.8 
 
 
510 aa  1069  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  8.34062e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  69.61 
 
 
517 aa  741  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  73.23 
 
 
508 aa  804  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.76707e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  68.76 
 
 
520 aa  742  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  65.02 
 
 
515 aa  696  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1740  SpoVR family protein  63.73 
 
 
502 aa  685  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0137532  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  82.64 
 
 
511 aa  911  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1070  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.66726e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2004  SpoVR family protein  86.44 
 
 
511 aa  921  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.07664e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1949  SpoVR family protein  85.21 
 
 
513 aa  935  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0479181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2245  SpoVR family protein  85.38 
 
 
519 aa  932  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0368477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  96.86 
 
 
510 aa  1046  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  97.06 
 
 
510 aa  1048  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.62879e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2156  SpoVR family protein  72.38 
 
 
508 aa  790  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0915233  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1591  SpoVR family protein  65.65 
 
 
559 aa  703  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.762696  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  67.29 
 
 
532 aa  702  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1530  SpoVR family protein  65.24 
 
 
559 aa  701  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376164  normal  0.61215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1227  SpoVR family protein  65.57 
 
 
578 aa  700  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1346  SpoVR family protein  99.61 
 
 
510 aa  1067  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00649322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2255  SpoVR family protein  65.51 
 
 
576 aa  702  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2048  SpoVR family protein  63.73 
 
 
502 aa  685  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0996469  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  96.67 
 
 
510 aa  1045  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  96.86 
 
 
510 aa  1046  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  97.06 
 
 
510 aa  1048  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02753  SpoVR family protein  72.45 
 
 
515 aa  775  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  74.75 
 
 
519 aa  818  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4753  SpoVR family protein  65.45 
 
 
559 aa  701  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135349  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  66.73 
 
 
516 aa  716  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  66.94 
 
 
520 aa  728  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  65.52 
 
 
507 aa  710  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3906  SpoVR family protein  64.86 
 
 
512 aa  696  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1135  SpoVR family protein  65.65 
 
 
507 aa  702  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  71.46 
 
 
521 aa  780  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  65.52 
 
 
507 aa  709  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1569  SpoVR family protein  73.59 
 
 
508 aa  810  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00678887  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3555  SpoVR family protein  64.46 
 
 
517 aa  699  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1636  SpoVR family protein  72.01 
 
 
504 aa  783  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000747677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  67.55 
 
 
523 aa  715  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2467  SpoVR family protein  65.02 
 
 
560 aa  694  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  65.02 
 
 
560 aa  694  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  66.67 
 
 
511 aa  718  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  67.13 
 
 
509 aa  729  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  67 
 
 
515 aa  724  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  65.52 
 
 
520 aa  716  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2007  SpoVR family protein  65.31 
 
 
552 aa  700  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  73.79 
 
 
508 aa  811  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  66.53 
 
 
520 aa  724  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  65.71 
 
 
538 aa  696  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1615  SpoVR family protein  65.65 
 
 
559 aa  703  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244629  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  73.04 
 
 
508 aa  808  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0395  SpoVR family protein  67.75 
 
 
522 aa  707  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466906  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1923  SpoVR family protein  74.34 
 
 
507 aa  797  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  6.04699e-06  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  100 
 
 
510 aa  1070  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.22624e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2706  SpoVR family protein  62.4 
 
 
507 aa  686  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  68.02 
 
 
519 aa  734  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2385  SpoVR family protein  66.53 
 
 
522 aa  697  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  65.02 
 
 
560 aa  694  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1070  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.3482e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3487  SpoVR family protein  69.82 
 
 
512 aa  758  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.241137  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1512  SpoVR family protein  65.24 
 
 
559 aa  702  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.854578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07650  SpoVR family protein  68.35 
 
 
517 aa  718  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  71.26 
 
 
508 aa  797  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1744  SpoVR family protein  71.49 
 
 
513 aa  767  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0535  SpoVR family protein  55.62 
 
 
505 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.468104  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1691  SpoVR family protein  56.06 
 
 
519 aa  538  1e-152  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0257  SpoVR family protein  54.95 
 
 
516 aa  540  1e-152  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111892  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1029  SpoVR family protein  54.47 
 
 
513 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0174  SpoVR family protein  53.96 
 
 
517 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00467153  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1223  SpoVR family protein  55.65 
 
 
522 aa  535  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297925  normal  0.137117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6312  SpoVR family protein  55.99 
 
 
512 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>