More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2698 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
396 aa  808    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  69.86 
 
 
434 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  61.13 
 
 
368 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  58.68 
 
 
435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  57.46 
 
 
373 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  51.53 
 
 
360 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  51.28 
 
 
388 aa  359  6e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  40.51 
 
 
386 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 
363 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  38.72 
 
 
352 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  40.4 
 
 
383 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  38.27 
 
 
352 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.4 
 
 
360 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  37.11 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  37.75 
 
 
352 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  42.21 
 
 
360 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  36.49 
 
 
381 aa  236  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.94 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  36.26 
 
 
366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1928  A/G-specific adenine glycosylase  42.33 
 
 
399 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2013  A/G-specific adenine glycosylase  43.1 
 
 
401 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  42.8 
 
 
386 aa  226  8e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  40.52 
 
 
365 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  34.93 
 
 
363 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  40.13 
 
 
365 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  40.52 
 
 
365 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  34.93 
 
 
363 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  40.2 
 
 
365 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  40.2 
 
 
365 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  37.91 
 
 
368 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  40.2 
 
 
365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  40.2 
 
 
365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  39.8 
 
 
365 aa  223  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  34.93 
 
 
363 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  39.5 
 
 
366 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  40.2 
 
 
365 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  39.8 
 
 
365 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  35.31 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.86 
 
 
342 aa  220  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  34.65 
 
 
363 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  45.99 
 
 
382 aa  219  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  37.74 
 
 
368 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  37.74 
 
 
368 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  37.74 
 
 
368 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  36.71 
 
 
355 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  40.79 
 
 
364 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.96 
 
 
372 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  35.87 
 
 
354 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  35.87 
 
 
354 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  35.53 
 
 
362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  37.43 
 
 
369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.96 
 
 
372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.29 
 
 
368 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.08 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  37.07 
 
 
354 aa  215  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  33.98 
 
 
350 aa  215  9e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  35.34 
 
 
355 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  35.97 
 
 
355 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  35.11 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.41 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  35.89 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  32.78 
 
 
353 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1951  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.95 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  38.03 
 
 
355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  37.43 
 
 
374 aa  213  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  35.89 
 
 
355 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  35.07 
 
 
355 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  36.91 
 
 
370 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  36.47 
 
 
362 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.47 
 
 
354 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.11 
 
 
344 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  36.81 
 
 
370 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  32.59 
 
 
350 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  36.83 
 
 
382 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 
368 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  34.28 
 
 
382 aa  209  9e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  38.46 
 
 
347 aa  209  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 
368 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 
368 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  33.6 
 
 
345 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 
368 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  33.6 
 
 
345 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 
368 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 
368 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 
368 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  39.3 
 
 
351 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  34.89 
 
 
419 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  40.23 
 
 
401 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.43 
 
 
355 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.31 
 
 
375 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  34.62 
 
 
372 aa  206  8e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.3 
 
 
368 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  32.98 
 
 
384 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  40.53 
 
 
374 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  34.62 
 
 
371 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  32.8 
 
 
399 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  36.96 
 
 
400 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.63 
 
 
384 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  35.77 
 
 
382 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>