45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2698 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2698  methyltransferase FkbM family  100 
 
 
579 aa  1196    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2875  hypothetical protein  37.99 
 
 
354 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0622  putative transferase  33.75 
 
 
320 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1869  hypothetical protein  34.91 
 
 
355 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0762  hypothetical protein  29.59 
 
 
343 aa  135  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4910  hypothetical protein  28.93 
 
 
326 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  27.42 
 
 
254 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  32.47 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2901  putative glycosyl transferase  28.83 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.344116  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  30.39 
 
 
219 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50348  predicted protein  29.29 
 
 
317 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515891  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49826  predicted protein  29.29 
 
 
317 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  26.24 
 
 
231 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  29.02 
 
 
322 aa  63.9  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1497  hypothetical protein  28.37 
 
 
241 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0111137  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  28.38 
 
 
256 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  29.41 
 
 
234 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1948  glycosyl transferase  28.48 
 
 
323 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.703364  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  30.49 
 
 
265 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  29.41 
 
 
271 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  27.75 
 
 
444 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  23.86 
 
 
238 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50607  predicted protein  28.18 
 
 
351 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  30.12 
 
 
314 aa  53.9  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0323  glycosyl transferase  28.66 
 
 
324 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.221565  normal  0.708301 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  25.57 
 
 
249 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  25.57 
 
 
249 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  29.02 
 
 
430 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  28.12 
 
 
569 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0046  methyltransferase FkbM family  28.03 
 
 
278 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0044  methyltransferase FkbM family  28.03 
 
 
278 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170743  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  28.67 
 
 
342 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37903  predicted protein  26.73 
 
 
293 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166915  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  28.47 
 
 
879 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  24.43 
 
 
320 aa  47.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  28.1 
 
 
243 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1207  hypothetical protein  29.51 
 
 
250 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  21.98 
 
 
264 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  26.67 
 
 
409 aa  44.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.73 
 
 
1644 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  29.41 
 
 
447 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.73 
 
 
1644 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  28.57 
 
 
459 aa  43.9  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13921  hypothetical protein  26.67 
 
 
338 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3000  FkbM family methyltransferase  27.23 
 
 
288 aa  43.9  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.22275  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>