More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2366 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 
131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0284  ferric uptake regulator family protein  70.63 
 
 
128 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0246387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3674  ferric uptake regulator family protein  69.05 
 
 
129 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1388  ferric uptake regulator, Fur family  64.29 
 
 
136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00327608  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0141  ferric uptake regulator, Fur family  56.59 
 
 
133 aa  150  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.896296  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  53.08 
 
 
137 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  47.66 
 
 
134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3251  ferric uptake regulator family protein  51.56 
 
 
158 aa  123  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  45.6 
 
 
139 aa  113  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0822  ferric uptake regulator family protein  46.34 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000300093  normal  0.0104511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  41.94 
 
 
144 aa  111  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0135  ferric uptake regulator, Fur family  38.17 
 
 
139 aa  103  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  41.46 
 
 
131 aa  102  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  41.94 
 
 
130 aa  102  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0754  ferric uptake regulator family protein  38.46 
 
 
143 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.354602  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0149  ferric uptake regulator, Fur family  38.89 
 
 
139 aa  100  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000946287  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  41.94 
 
 
138 aa  100  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  44 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3815  ferric uptake regulator family protein  38.93 
 
 
132 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25080  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  43.55 
 
 
130 aa  99  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0101  ferric uptake regulator, Fur family  38.89 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133113  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0153  ferric uptake regulator, Fur family  38.1 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000104646  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  38.71 
 
 
128 aa  98.2  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  41.41 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  40.94 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  40.46 
 
 
154 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  39.2 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  37.6 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  37.6 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  40.46 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
150 aa  90.5  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  37.98 
 
 
150 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
147 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  40.16 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  39.02 
 
 
146 aa  88.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  35.88 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  35.88 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  35.94 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  35.94 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  35.88 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  35.88 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  35.94 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  37.8 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  36 
 
 
166 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  37.4 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1037  ferric uptake regulator family protein  44.83 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0953137  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2198  ferric uptake regulator, Fur family  33.59 
 
 
169 aa  84  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1224  ferric uptake regulator family protein  36.36 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  35.71 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0584  ferric uptake regulator family protein  35.16 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.274905  normal  0.220198 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  29.77 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  35.54 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  36.3 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  36.3 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  34.45 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0480  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  34.13 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  34.13 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1188  ferric uptake regulator, Fur family  33.07 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  34.11 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2002  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0758566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  33.61 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  34.11 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1073  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  35.48 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  41.9 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3112  ferric uptake regulator family protein  36.76 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.966736  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0367  FUR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
136 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.596718  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  32.85 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  33.06 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  32.56 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1641  FUR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1963  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1296  FUR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0263  FUR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  31.71 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  35.88 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  34.68 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0222  ferric-uptake regulator  36.17 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>