70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0051 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0051  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 148 aa  285  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.596905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5152  transcriptional regulator, LuxR family  26.56 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2423  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  26.37 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0647995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  31.58 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3249  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.82 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00663689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  28.86 
 
 		 256 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  30.2 
 
 		 234 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1260  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.4 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000065145  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  32.67 
 
 		 237 aa  47.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  32.67 
 
 		 237 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  32.67 
 
 		 237 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  32.67 
 
 		 237 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  32.67 
 
 		 237 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  32.67 
 
 		 237 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  32.67 
 
 		 237 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  32.67 
 
 		 237 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  32.67 
 
 		 265 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  32.67 
 
 		 237 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8847  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.56 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  32.45 
 
 		 236 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1297  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  27.1 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000823001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5045  RNA polymerase factor sigma-70  28.87 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3158  sigma-70 region 4 domain-containing protein  24.49 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.579864  normal  0.0761655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5370  RNA polymerase factor sigma-70  30.61 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  47.06 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0984  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.5 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3654  sigma-70, region 4 type 2  28.3 
 
 		 172 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0480058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0281  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.62 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1156  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.17 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493631  normal  0.957952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3571  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.7 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0705  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.7 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2776  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.84 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.835774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6922  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.5 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9023  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.21 
 
 		 172 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.988246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5776  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.58 
 
 		 188 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3488  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  36.36 
 
 		 256 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0106  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  43.75 
 
 		 200 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00950  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family/RNA polymerase sigma-70 factor, sigma-E family  26.39 
 
 		 197 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4646  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  22.22 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0119  LuxR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5493  RNA polymerase factor sigma-70  29.25 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4947  RNA polymerase factor sigma-70  29.66 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0787  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.84 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.678164  normal  0.0288483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4207  RNA polymerase sigma factor SigK  21.37 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1591  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.17 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5102  RNA polymerase factor sigma-70  29.25 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5342  RNA polymerase factor sigma-70  30.34 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4932  RNA polymerase factor sigma-70  28.57 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1905  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.49 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0794  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.97 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  27.15 
 
 		 239 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0677  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.92 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3783  RNA polymerase factor sigma-70  27.69 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38280  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family/RNA polymerase sigma-70 factor, sigma-E family  39.58 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2148  RNA polymerase sigma factor  30.82 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0003  bacteriocin uviA  26.22 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  30.92 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  30.92 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1055  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.79 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0030  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.09 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1945  RNA polymerase sigma factor  30.82 
 
 		 192 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0207098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  28.48 
 
 		 241 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1966  RNA polymerase sigma factor  30.82 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2114  RNA polymerase sigma factor  30.82 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  43.86 
 
 		 255 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  41.67 
 
 		 256 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  41.3 
 
 		 245 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2124  RNA polymerase sigma factor  30.82 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  31.33 
 
 		 244 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  40 
 
 		 257 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>